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陕西省鼠疫耶尔森菌间区规律短回文重复序列基因分型研究及流行病学分析
文献摘要：
目的 通过CRISPR(间区规律短回文重复序列)对陕西省鼠疫菌进行基因分型,分析流行病学特征,为陕西省鼠疫防治工作提供科学依据.方法 提取分离自陕西省鼠疫疫源地的66株鼠疫菌核酸,利用针对鼠疫菌的3对CRISPR引物进行PCR扩增,对扩增产物进行测序及分析,确定CRISPR基因分型.结果 66株鼠疫菌在3个位点上共有12种spacer,其中 YPa3种、YPb5种、YPc4种,具体为 a1′、a2′、a3′、b1′、b2′、b29′、b1″、b2″、c1、c2、c3、c3′,基因簇为 Cb2′,基因型分为 1′和4′两种.结论 疫情发生年份不同,鼠疫菌CRISPR基因型不同,鼠疫疫情处置进行溯源应将生态分型与基因分型结合.
文献关键词：
陕西;鼠疫菌;间区规律短回文重复序列(CRISPR);流行病学
中图分类号：
作者姓名：
聂守民;罗波艳;孙养信;范锁平;常文辉;孙杰;安翠红
作者机构：
陕西省疾病预防控制中心,西安 710054;澄城县疾病预防控制中心,澄城 715200
文献出处：
引用格式：
[1]聂守民;罗波艳;孙养信;范锁平;常文辉;孙杰;安翠红-.陕西省鼠疫耶尔森菌间区规律短回文重复序列基因分型研究及流行病学分析)[J].中国人兽共患病学报,2022(02):182-186
A类：
YPa3,YPb5,YPc4,b29,Cb2
B类：
鼠疫耶尔森菌,回文,重复序列,基因分型,分型研究,流行病学分析,CRISPR,鼠疫菌,流行病学特征,防治工作,提取分离,鼠疫疫源地,菌核,引物,扩增产物,个位,spacer,a1,a2,b1,c1,c2,c3,基因簇,基因型,生年,疫情处置
AB值：
0.288632
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