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青海省格尔木市鼠疫耶尔森菌生化特征及基因分型研究
文献摘要：
目的 了解青海省格尔木市鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis)的生化特征,进行规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)基因分型和差异区段(DFR)研究,为青海省格尔木市鼠疫菌鉴定溯源、鼠疫科学防控提供理论依据.方法 选取1967年以来青海省格尔木市境内从人尸、宿主动物及媒介昆虫体内分离出28株鼠疫菌,通过糖醇酵解实验,研究其生化特征.采用十二烷基磺酸钠裂解和苯酚-氯仿法提取鼠疫菌DNA.分别对CRISPR的YPa、YPb和YPc 3个位点进行PCR扩增并测序,然后将所测得CRISPR序列与文献最新报道的CRISPR Dictionary和NCBI数据库检索比对,以鉴定CRISPR spacer阵列.最后根据CRISPR spacer阵列的多态性对青海省格尔木市鼠疫菌进行基因分型.采用23对DFR(DFR01-DFR23)分型引物和质粒验证引物(PMT1)对试验菌株DNA进行分型验证.结果 鼠疫菌糖醇类酵解表型特征研究结果显示,28株鼠疫菌对甘油、阿胶糖、麦芽糖的酵解均为阳性,对鼠李糖、蜜二糖、脱氮的酵解均为阴性.CRISPR分型发现10种spacer,包括YPa5种、YPb4种、YPc 1种,a105和b51是新发现spacer.28株鼠疫菌归类为8个基因型,分为5个CRISPR类群:Cb4、Cb4'、Ca7、Ca7'和Ca35'.DFR分型可分为4个基因组型,分别为32型、5型、8型和49型.该地区主要基因组型为32型和5型.结论 青海省格尔木市鼠疫菌均为青藏高原型,当地鼠疫菌基因型较少,遗传较为稳定,具有明显的地区分布特征.同一地区不同菌株基因型有差异,存在鼠疫菌菌株微进化.
文献关键词：
鼠疫菌;基因分型;生化特征;青海省格尔木市
中图分类号：
作者姓名：
辛文媛;张丽;代瑞霞
作者机构：
青海省地方病预防控制所,青海西宁810021
文献出处：
引用格式：
[1]辛文媛;张丽;代瑞霞-.青海省格尔木市鼠疫耶尔森菌生化特征及基因分型研究)[J].中国热带医学,2022(06):500-504
A类：
pestis,YPa,YPb,YPc,DFR01,DFR23,PMT1,YPa5,YPb4,a105,b51,Cb4,Ca7,Ca35
B类：
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AB值：
0.223718
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