典型文献
广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定
文献摘要:
采用小RNA(sRNA)深度测序技术,结合RT-PCR技术对广西9个辣椒主产区具有典型病毒病症状的病样进行检测,共发现10种病毒,其中小米椒内源RNA病毒1(Capsicum frutescens endornavirus 1,CFEV 1)、辣椒潜隐病毒 2(pepper cryptic virus 2,PCV 2)、烟草轻型绿花叶病毒(tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和辣椒黄脉病毒(pepper vein yellows virus,PeVYV)是在广西辣椒上首次发现,且CFEV 1在中国是首次发现.10种病毒在75份辣椒病样中的总检出率为8.00%~66.67%,前5位依次为辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV,66.67%)、甜椒脉斑驳病毒(pepper veinal mottle virus,PVMV,62.67%)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV,41.33%)、CFEV 1(32.0%)以及PCV 2(26.67%).ChiVMV、PVMV、CMV和CFEV 1在广西7~9个辣椒主产区广泛分布,推测为优势病毒.除桂林外,其他8个辣椒主产区均含以上4种优势病毒中的1~3种,但在桂林,这4种病毒的检出率偏低或检不出,其优势病毒种类是PMMoV和PCV2.广西辣椒病毒病复合侵染率为94.66%,3种(检出率42.67%)和4种(检出率24.00%)病毒复合侵染是主要形式.3种复合侵染中以ChiVMV+PVMV+CMV 和 ChiVMV+CFEV 1+ChiRSV 占比最高(均为 18.75%),4 种复合侵染中以 ChiVMV+PVMV+CMV+CFEV 1 占比最高(16.67%).
文献关键词:
辣椒;病毒病;小RNA;深度测序;RT-PCR;分子鉴定
中图分类号:
作者姓名:
龚明霞;赵虎;王萌;吴星;赵曾菁;何志;黄金梅;孟生德;王日升
作者机构:
广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所,广西蔬菜育种与新技术研究重点实验室,南宁530007;甘肃省敦煌种业集团股份有限公司,甘肃酒泉735008
文献出处:
引用格式:
[1]龚明霞;赵虎;王萌;吴星;赵曾菁;何志;黄金梅;孟生德;王日升-.广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定)[J].园艺学报,2022(05):1060-1072
A类:
endornavirus,CFEV,TMGMV,PeVYV,chilli,veinal,ChiVMV,PVMV,PMMoV,ChiVMV+PVMV+CMV,ChiVMV+CFEV,1+ChiRSV,ChiVMV+PVMV+CMV+CFEV
B类:
sRNA,深度测序,主产区,病症状,小米,Capsicum,frutescens,潜隐,pepper,cryptic,烟草,轻型,tobacco,mild,green,mosaic,yellows,上首,斑驳,mottle,甜椒,黄瓜花叶病毒,cucumber,桂林,不出,病毒种类,PCV2,辣椒病毒病,复合侵染,侵染率,主要形式,分子鉴定
AB值:
0.245518
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