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典型文献
2020年河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子流行病学调查及ORF5基因变异分析
文献摘要:
为了解河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行及变异情况,对2020年采集于河南的401份PRRSV感染疑似病料进行TaqMan荧光定量PCR(FQ-PCR)检测.结果显示,共检测出100份阳性样品,阳性率为24.9%.对其中18株PRRSV流行毒株ORF5基因进行测序、同源性比对和遗传进化分析.同源性比对结果显示,18株PRRSV流行毒株ORF5基因核苷酸序列同源性在83.4%以上,与参考毒株同源性为82.9%~99.7%.遗传进化分析结果显示,18株PRRSV流行毒株序列均为美洲株,分属于1、5、8三个谱系,其中2株属于以JXA1为代表的谱系8,1株属于以VR2332为代表的谱系5,15株属于以NADC30为代表的谱系1.氨基酸比对结果显示,HN-TH1-2020、HY-PY1-2020、HN-XY1-2020毒株的13位以及HN-XC1-2020毒株的151位氨基酸毒力相关位点发生了不同程度的突变.
文献关键词:
河南省;猪繁殖与呼吸综合征病毒;分子流行病学;ORF5基因;变异
作者姓名:
郭占达;杜季梅;郭子仪;王新港;张彦华
作者机构:
河南省大河农畜牧科技有限公司,河南郑州450000;河南农业大学动物医学院,河南郑州450000;商丘美兰生物工程有限公司,河南柘城476200;河南农业大学动物科学院,河南郑州450000
文献出处:
引用格式:
[1]郭占达;杜季梅;郭子仪;王新港;张彦华-.2020年河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子流行病学调查及ORF5基因变异分析)[J].河南农业科学,2022(03):146-153
A类:
PY1,XC1
B类:
猪繁殖与呼吸综合征病毒,分子流行病学,流行病学调查,ORF5,基因变异,变异分析,PRRSV,变异情况,TaqMan,FQ,流行毒株,遗传进化分析,序列同源性,美洲,分属,JXA1,VR2332,NADC30,HN,TH1,HY,XY1,毒力
AB值:
0.260322
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