典型文献
一株花椒根腐病拮抗菌的分离鉴定及全基因组序列分析
文献摘要：
[背景]花椒根腐病的防治一直是生产中难以解决的问题,优良生防菌的筛选是微生物菌剂研发的重要方向.[目的]解析花椒根腐病拮抗菌T-1的遗传信息,深入挖掘其拮抗基因簇资源,揭示该菌的拮抗机制.[方法]采用平板对峙法、形态观察、生理生化测定结合分子生物学等方法进行拮抗菌的分离鉴定,同时对菌株进行全基因组测序,并对其序列进行分析及比较基因组学分析.[结果]分离获得的菌株经鉴定为贝莱斯芽孢杆菌,编号T-1,该菌对花椒根腐病的抑制率可达72％,可使菌丝前端的生长严重受阻,抑菌谱检测和花椒根片的离体拮抗试验结果表明,拮抗菌T-1具有较广的抑菌活性且离体状态下对花椒根片具有一定的拮抗作用.其全基因组序列数据提交到NCBI的SRA数据库中获得登录号为SRX11086663,基因组总长为3 886 726 bp,GC含量为46.42％,全基因组中有4 015个编码基因,占总基因组的89.74％,比较基因组学分析结果显示,菌株T-1与贝莱斯芽孢杆菌模式菌株FZB42相似性高,拮抗基因簇预测结果发现B.velezensis T-1基因组序列中有12个编码次级代谢产物基因合成簇,其中8个与已知功能基因簇高度相似,分别为butirosin A/butirosin B、macrolactin H、backland、泛革素(fengycin)、difficidin、bacillibactin、溶杆菌素(bacilysin)和表面活性素(surfactant),4个基因簇功能未知.[结论]本研究明确了拮抗菌T-1全基因组的遗传信息,获得了拮抗基因相关的基因簇,为后期研究该菌株在抑菌方面的分子机理提供了参考.
文献关键词：
贝莱斯芽孢杆菌;全基因组序列;拮抗基因;次级代谢产物
中图分类号：
作者姓名：
田凤鸣;陈强;何九军;卓平清;王让军;王国斌;张晓娜
作者机构：
陇南师范高等专科学校农林技术学院,甘肃陇南742500;陇南特色农业生物资源研究开发中心,甘肃陇南742500;武都区花椒服务中心,甘肃陇南742500
文献出处：
引用格式：
[1]田凤鸣;陈强;何九军;卓平清;王让军;王国斌;张晓娜-.一株花椒根腐病拮抗菌的分离鉴定及全基因组序列分析)[J].微生物学通报,2022(08):3205-3219
A类：
拮抗基因,SRX11086663,butirosin,backland,difficidin,bacillibactin,bacilysin
B类：
一株,花椒根,根腐病,拮抗菌,分离鉴定,全基因组序列分析,难以解决,生防菌,微生物菌剂,遗传信息,基因簇,拮抗机制,平板对峙法,形态观察,生理生化,分子生物学,全基因组测序,比较基因组学分析,贝莱斯芽孢杆菌,编号,抑制率,菌丝,抑菌谱,离体,拮抗试验,抑菌活性,拮抗作用,序列数据,提交,交到,NCBI,SRA,登录号,总长,bp,编码基因,FZB42,velezensis,次级代谢产物,基因合成,功能基因,macrolactin,泛革素,fengycin,溶杆菌,菌素,表面活性素,surfactant,分子机理
AB值：
0.256727
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
