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宁夏枸杞根际土壤链霉菌V-1-3次级代谢产物分析
文献摘要：
目的 获得链霉菌V-1-3的基因组序列信息,分析其次级代谢产物生物合成基因簇并预测其代谢产物,为发现潜在新抗生素奠定基础.方法 基于16S rRNA基因序列进行菌株属水平鉴定,利用Illumina HiSeq+PacBio测序技术对菌株V-1-3进行基因组测序,采用antiSMASH(v6.0.1)在线工具分析次级代谢产物生物合成基因簇,液-质联用技术检测产生的次级代谢产物.结果 链霉菌V-1-3基因组序列全长8 243 417 bp,平均(G+C)含量为72.14％,共编码7578个基因,预测到33个生物合成基因簇,利用液-质联用检测到4个代谢物:oxalomycin B、geosmin、coelichelin和ishigamide.结论 来自盐碱地的链霉菌V-1-3具有丰富的次级代谢产物生物合成基因簇,能产生多种次级代谢产物,具有进一步发掘新抗生素的价值.
文献关键词：
盐碱地;链霉菌;全基因组测序;次级代谢产物
中图分类号：
作者姓名：
胡运琪;马晓莉;贾荣亮;林文星;郭欢欢;李彬;李舂龙;南泽东;吴秀丽;江志波
作者机构：
北方民族大学化学与化学工程学院化工技术基础国家民委重点实验室,银川750021;中国科学院西北生态环境资源研究院甘肃省寒区旱区逆境生理与生态重点实验室,兰州730000;宁夏医科大学药学院,银川750004;北方民族大学实验室建设与管理处,银川750021
文献出处：
引用格式：
[1]胡运琪;马晓莉;贾荣亮;林文星;郭欢欢;李彬;李舂龙;南泽东;吴秀丽;江志波-.宁夏枸杞根际土壤链霉菌V-1-3次级代谢产物分析)[J].中国抗生素杂志,2022(07):647-653
A类：
HiSeq+PacBio,oxalomycin,coelichelin,ishigamide
B类：
宁夏枸杞,根际土壤,链霉菌,次级代谢产物,产物分析,基因组序列,序列信息,生物合成基因簇,16S,rRNA,基因序列,Illumina,antiSMASH,v6,联用技术,测产,全长,bp,G+C,代谢物,geosmin,盐碱地,全基因组测序
AB值：
0.210588
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