典型文献
茎瘤芥根际一株产紫色杆菌素杜擀氏菌的分离鉴定及其基因组分析
文献摘要：
[目的]对茎瘤芥根际微生物进行分离鉴定,分析微生物菌群构成,选择具有优良特性的菌株,评估其次级代谢产物合成能力,为茎瘤芥根际微生物多样性和菌种资源的挖掘利用奠定基础.[方法]采集重庆市涪陵区二渡村和邓家村的茎瘤芥根,分离培养根际微生物菌株,通过菌株形态观察和看家基因的序列分析,对菌株进行初步鉴定、归类和保存.选择具有优良性状的菌株,利用Pacbio RS Ⅱ和Illumina HiSeq平台完成全基因组测序,通过antiSMASH分析评估其次级代谢产物合成潜力,克隆目的基因簇并进行异源表达和产物鉴定.[结果]分离得到256株微生物,初步鉴定120株;从中鉴定了一株产紫色杆菌素的杜擀氏菌BjR8,完成了基因组测序及分析,发现该菌基因组为一条环状染色体,全长7 205 593 bp,GC含量为64.67％,含有6 241个编码基因.生物信息学分析发现基因组含有9个次级代谢产物生物合成基因簇,其中7个基因簇与已知化合物编码基因簇同源性较低,说明该菌具有产生多种新型次级代谢产物的潜力;克隆得到紫色杆菌素生物合成基因簇,并在变铅青链霉菌TK23中完成了异源表达.[结论]从茎瘤芥根际分离得到256株微生物,初步分析了茎瘤芥根际的微生物菌群构成;完成了 一株产紫色杆菌素杜擀氏菌的基因组测定与分析,从中克隆了紫色杆菌素基因簇,并成功在链霉菌中实现异源表达.
文献关键词：
根际微生物;杜擀氏菌;紫色杆菌素;基因组测序;生物合成基因簇;异源表达
中图分类号：
作者姓名：
邹莹;吴嘉炳;张雨欣;李殿怡;牛国清;司军
作者机构：
西南大学农业科学研究院,生物技术中心,重庆400715;西南大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715;西南大学园艺园林学院,南方山地园艺学教育部重点实验室,重庆400715
文献出处：
引用格式：
[1]邹莹;吴嘉炳;张雨欣;李殿怡;牛国清;司军-.茎瘤芥根际一株产紫色杆菌素杜擀氏菌的分离鉴定及其基因组分析)[J].微生物学报,2022(11):4122-4140
A类：
紫色杆菌素,BjR8,TK23
B类：
茎瘤芥,一株,株产,杜擀氏菌,分离鉴定,基因组分析,微生物菌群,菌群构成,优良特性,次级代谢产物,产物合成,合成能力,根际微生物多样性,菌种资源,挖掘利用,重庆市涪陵区,家村,分离培养,微生物菌株,形态观察,看家基因,序列分析,优良性状,Pacbio,RS,Illumina,HiSeq,全基因组测序,antiSMASH,分析评估,目的基因,异源表达,全长,bp,编码基因,生物信息学分析,生物合成基因簇,同源性,链霉菌,初步分析
AB值：
0.220079
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