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一株利福平高耐受鸭疫里默氏杆菌的分离鉴定及基因组分析
文献摘要:
鸭疫里默氏杆菌(RA)为一种可引起鸭、鹅、鸡、火鸡等禽类急性或慢性败血症的革兰氏阴性菌,是鸭场重要病原菌之一.本研究利用鸭疫里默氏杆菌三重PCR鉴定方法,从养殖场病鸭的脏器中分离、鉴定出一株鸭疫里默氏杆菌,将其命名为RA-WH9;通过血清型鉴定实验和Kirby-Bauer药敏实验,确定了其血清型和药敏性;利用细菌基因组三代测序技术和生物信息学平台,我们构建并分析了RA-WH9基因组完成图.结果表明,RA-WH9为1型血清型鸭疫里默氏杆菌,对氨苄西林、多粘菌素B和利福平等抗生素耐药,其对利福平最小抑菌浓度达到50μg/mL.全基因组序列分析表明,RA-WH9染色体总长度为2488018 bp,GC含量34.58%,编码2563个基因,其中包含88个耐药基因,其耐药基因型与耐药表型一致.此外,RA-WH9携带一个全长10736 bp的质粒.本研究丰富了鸭疫里默氏杆菌的基因库,为鸭疫里默氏杆菌病的防控提供了依据.
文献关键词:
鸭疫里默氏杆菌;利福平;耐药;基因组分析
中图分类号:
作者姓名:
刘玲俐;赵亚楠;靳亚洁;祁晶晶;田明星;王少辉;李涛;于圣青
作者机构:
中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241
文献出处:
引用格式:
[1]刘玲俐;赵亚楠;靳亚洁;祁晶晶;田明星;王少辉;李涛;于圣青-.一株利福平高耐受鸭疫里默氏杆菌的分离鉴定及基因组分析)[J].中国动物传染病学报,2022(04):20-30
A类:
WH9
B类:
一株,利福平,鸭疫里默氏杆菌,分离鉴定,基因组分析,RA,火鸡,禽类,败血症,革兰氏阴性菌,研究利用,用鸭,鉴定方法,养殖场,脏器,血清型,Kirby,Bauer,药敏实验,药敏性,细菌基因组,三代测序技术,基因组完成图,氨苄西林,多粘菌素,抗生素耐药,最小抑菌浓度,全基因组序列分析,体总,总长度,bp,耐药基因型,耐药表型,全长,质粒,基因库
AB值:
0.299034
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