典型文献
牦牛源多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及基因组功能分析
文献摘要:
为了丰富西藏牦牛巴氏杆菌基因组相关研究数据,分析其潜在毒力因子基因和耐药基因,为下一步研究其致病机理提供遗传学支持数据.无菌采集病死牦牛的脾脏,分离培养1株细菌,经过VITEK2全自动微生物鉴定、16 S rRNA比对和荚膜血清型PCR鉴定,确定分离菌株类型,经全基因组测序,对分离菌株进行VFDB、COG、CARD、KEGG数据库比对注释,确定基因的功能及相关描述信息.结果显示,Tbs20为A型多杀性巴氏杆菌,命名为Tbs20,分离菌株Tbs20基因组全长3061796 bp,基因数量2852个,基因平均长度911.57 bp,C+G含量47.26%.非编码RNA 116个(4.07%),重复序列数151个(5.29%),确定了全基因组中的2395个COG、2127个KEGG基因和177个毒力因子,未发现耐药基因.结果表明,分离菌株Tbs20预测到的毒力因子和其他相关报道存在一定差异,且未检测到耐药基因的存在,与其他相关研究结果不同,这可能与西藏特殊的地理位置和极少使用抗菌药物有关.研究结果可为牦牛巴氏杆菌病的免疫和治疗提供参考依据.
文献关键词:
牦牛;多杀性巴氏杆菌;分离鉴定;基因注释
中图分类号:
作者姓名:
王俊书;徐进强;封家旺;顾庆云;赵晓民;金红岩
作者机构:
西藏职业技术学院西藏兽药重点实验室,西藏拉萨 850030;天津津垦牧业集团有限公司,天津 300380;西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌 712100
文献出处:
引用格式:
[1]王俊书;徐进强;封家旺;顾庆云;赵晓民;金红岩-.牦牛源多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及基因组功能分析)[J].动物医学进展,2022(06):27-31
A类:
Tbs20
B类:
牦牛源,多杀性巴氏杆菌,分离鉴定,功能分析,西藏牦牛,研究数据,毒力因子,耐药基因,致病机理,遗传学,无菌,脾脏,分离培养,VITEK2,微生物鉴定,rRNA,荚膜血清型,分离菌株,菌株类型,全基因组测序,VFDB,COG,CARD,库比,基因组全长,bp,平均长度,C+G,非编码,重复序列,未检,极少,抗菌药物,牛巴氏杆菌病,基因注释
AB值:
0.296887
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