典型文献
人体肠道4644株代表菌次级代谢产物生物合成基因簇挖掘与耐药及毒力基因分析
文献摘要：
为了更好地从肠道微生物组中挖掘新的次级代谢产物、了解肠道微生物组编码的抗生素耐药基因和毒力因子情况,本研究基于4 644株人体肠道微生物代表菌的基因组序列,对其编码的次级代谢产物基因簇、抗生素耐药基因和毒力因子进行了预测分析.经antiSMASH预测分析发现,超过60％的代表菌编码至少1个次级代谢产物基因簇,并从8个未可培养菌中发现了 8个潜在的新颖次级代谢产物基因簇.人体肠道中的次级代谢产物主要由梭菌纲(Clostridia)、芽孢杆菌纲(Bacilli)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、拟杆菌纲(Bacteroidia)、放线菌纲(Actinobacteria)和厚壁菌纲(Negativicutes)6类细菌编码的非核糖体多肽合成酶(nonribosomal peptide synthetase,NRPS)、细菌素、芳基多烯类化合物、萜烯、β-丙内酯、NRPS-样蛋白组成.经PathoFact预测分析发现,抗生素耐药基因和毒力因子在代表性菌株中分布广泛,但潜在病原菌编码频率更高.潜在病原菌中编码外膜蛋白、PapC N-端结构域、PapC C-端结构域、肽酶M16失活结构域等分泌型毒素和硝基还原酶家族、AcrB/AcrD/AcrF家族、PLD-样结构域、Cupin结构域、假定溶血素、S24-样肽酶、磷酸转移酶家族、内切核酸酶/外切核酸酶/磷酸酶家族、乙二醛酶/博莱霉素抗性等非分泌型毒素的频率较高.该研究将为进一步从肠道微生物组中挖掘新的微生物天然产物、了解肠道微生物的定殖与感染机制,为肠道微生物相关疾病提供靶向防治策略等奠定基础.
文献关键词：
肠道菌群;代表性菌株;次级代谢产物;抗生素耐药基因;毒力因子
中图分类号：
作者姓名：
尹业师;陈浒;张美红;曹林艳;陈华海
作者机构：
湖南科技学院化学与生物工程学院湖南南岭地区植物资源研究开发湖南省工程研究中心湘南优势植物资源综合利用湖南省重点实验室,湖南永州425199;中国农业大学动物科学技术学院动物营养学国家重点实验室,北京100193
文献出处：
引用格式：
[1]尹业师;陈浒;张美红;曹林艳;陈华海-.人体肠道4644株代表菌次级代谢产物生物合成基因簇挖掘与耐药及毒力基因分析)[J].生物工程学报,2022(10):3682-3694
A类：
nonribosomal,多烯类,PathoFact,PapC,AcrD,AcrF,Cupin
B类：
生物合成基因簇,毒力基因,基因分析,肠道微生物组,抗生素耐药基因,毒力因子,基因组序列,次级代谢产物基因簇,预测分析,antiSMASH,可培养菌,梭菌,Clostridia,芽孢杆菌,Bacilli,Gammaproteobacteria,拟杆菌,Bacteroidia,放线菌纲,Actinobacteria,和厚壁,厚壁菌,Negativicutes,非核糖体多肽,合成酶,peptide,synthetase,NRPS,细菌素,芳基,基多,类化合物,萜烯,内酯,蛋白组成,代表性菌株,码频率,外膜蛋白,结构域,肽酶,M16,失活,活结,硝基还原,还原酶,AcrB,PLD,假定,溶血素,S24,转移酶,内切,核酸酶,外切,乙二醛酶,博莱霉素,非分,微生物天然产物,定殖,感染机制,相关疾病,防治策略,肠道菌群
AB值：
0.330584
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
