典型文献
基于比较基因组学的高地芽孢杆菌6ww6分子标识筛选及其快速鉴定
文献摘要：
[目的 ]高地芽孢杆菌(Bacillus altitudinis)6ww6是一株根际耐盐促生菌,可以作为微生物肥料的优选菌种.为了加强菌种知识产权保护,建立菌株快速检测方法.[方法]本研究通过基因组比对分析、TBLASTn检索、NR库检索验证并剔除有其他同源的结果序列,最终得到菌株6ww6的孤儿基因,设计引物进行PCR鉴定.[结果]筛选出5个特异性基因J939_13195、J9319_05960、J9319_13355、J9319_05965 和 J9319_13350.引物 5960F 和 5960R 可以单一性扩增出菌株6ww6的目的基因J9319_05960,确定其为菌株6ww6的特异性分子标识.[结论]本研究确定了菌株6ww6的唯一性身份编码,建立了以比较基因组学和孤儿基因为基础的菌株水平上的鉴定方法.该方法具有快速、精确、能鉴定到菌株水平的优点,对于有价值微生物的知识产权保护提供了有力的抓手.
文献关键词：
微生物肥料;比较基因组学;菌株分子标识;高地芽孢杆菌6ww6;知识产权
中图分类号：
作者姓名：
李旭健;杜秉海;殷志秋;程齐;周丹丹;汪城墙;李慧;刘凯;丁延芹
作者机构：
山东农业大学生命科学学院,山东泰安271018;山东省盐碱地植物-微生物联合修复工程技术中心,山东泰安271018;山东农业大学资源与环境学院,山东 泰安271018
文献出处：
引用格式：
[1]李旭健;杜秉海;殷志秋;程齐;周丹丹;汪城墙;李慧;刘凯;丁延芹-.基于比较基因组学的高地芽孢杆菌6ww6分子标识筛选及其快速鉴定)[J].微生物学报,2022(10):3741-3750
A类：
6ww6,TBLASTn,J939,J9319,5960F,5960R,菌株分子标识
B类：
比较基因组学,高地芽孢杆菌,快速鉴定,Bacillus,altitudinis,一株,根际,耐盐促生菌,微生物肥料,菌种,知识产权保护,快速检测方法,比对分析,NR,库检索,孤儿,引物,特异性基因,单一性,目的基因,唯一性,株水平,鉴定方法
AB值：
0.18568
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