典型文献
多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用
文献摘要：
本文通过16S rRNA基因和多位点序列分型(MLST)技术,对凝结芽孢杆菌不同菌株进行亲缘关系分析.试验选取国内具有代表性的15株凝结芽孢杆菌菌株,菌株纯化后提取基因组DNA,采用传统的16S rRNA基因分子鉴定和MLST技术相结合进行分析.其中MLST采用5个管家基因:adk、recF、sucC、rpoB和spoOA,结合参考凝结芽孢杆菌菌株DSM1的已知管家基因序列,用CE Design V1.04软件设计引物进行PCR扩增,测序结果剪接、串联后,做系统进化树分析.结果 显示:16S rRNA基因显示所有菌株的基因序列相似性在99％以上,无法区分菌株间的差异性.而MLST结果显示,国内大部分凝结芽孢杆菌菌株G1-G9、E21和Y1、Y2为第一类别(Bootstrap值≥99),Y3、Y4、Y5三个菌株为第二类别(Bootstrap值≥99),参考菌株DSM1和国内凝结芽孢杆菌菌株差异较大为第三类别.
文献关键词：
凝结芽孢杆菌;多位点序列分型(MLST);管家基因;亲缘关系
中图分类号：
作者姓名：
冯海霞;王金龙;吕伟;刘胜利;马艳艳
作者机构：
青岛尚德生物技术有限公司,山东青岛266111;山东隆科特酶制剂有限公司,山东临沂276400
文献出处：
引用格式：
[1]冯海霞;王金龙;吕伟;刘胜利;马艳艳-.多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用)[J].中国饲料,2022(03):39-42
A类：
adk,recF,sucC,spoOA,DSM1
B类：
多位点序列分型,凝结芽孢杆菌,16S,rRNA,MLST,亲缘关系分析,分子鉴定,技术相结合,管家基因,rpoB,基因序列,CE,Design,V1,软件设计,引物,剪接,系统进化树分析,G1,G9,E21,Y1,Y2,第一类,Bootstrap,Y3,Y4,Y5,第二类,参考菌株,第三类
AB值：
0.272389
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