典型文献
不同施肥处理农田土壤中噬菌体与细菌携带抗生素抗性基因的比较
文献摘要：
为了揭示有机肥和化肥长期施用对农田土壤噬菌体携带的抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)多样性和丰度的影响,并与土壤细菌携带的ARGs进行对比,本文将土壤抗生素抗性分为细菌和噬菌体两个部分,利用微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)技术定量分析了土壤噬菌体和细菌DNA中25种ARGs亚型和I类整合子(intl1)的丰度.结果表明,土壤噬菌体中ARGs的检出率和总丰度以及intl1丰度均低于土壤细菌,其中噬菌体中检测到20种ARGs亚型,在不施肥、单施化肥和单施有机肥土壤的噬菌体中,目标ARGs的检出率分别为68％、72％和76％.土壤噬菌体中ARGs的总丰度在有机肥施用土壤中显著高于不施肥和化肥施用土壤(P<0.05),其中多耐药类、大环内酯-林肯酰胺-链阳性菌素B(MLSB)类和β-内酰胺类抗性基因丰度占显著优势.除了β-内酰胺类抗性基因blaTEM,噬菌体中其他ARGs亚型的丰度均显著低于细菌(P<0.05).噬菌体与细菌携带ARGs在不同施肥处理中均存在显著正相关(P<0.05).冗余分析结果显示,施肥可能通过改变土壤pH、重金属和营养因子水平来影响细菌和噬菌体中ARGs的赋存特征.本研究结果表明,噬菌体是除细菌之外的农田土壤另一个重要ARGs储存库,施用有机肥能同时显著提高土壤细菌和噬菌体中ARGs的多样性和丰度.
文献关键词：
抗生素抗性基因;噬菌体;农田土壤;微滴数字PCR;冗余分析
中图分类号：
作者姓名：
胡雪莹;张越;郭雅杰;仇天雷;高敏;孙兴滨;王旭明
作者机构：
东北林业大学林学院, 哈尔滨150040;北京市农林科学院生物技术研究所农业基因资源与生物技术北京市重点实验室,北京 100097
文献出处：
引用格式：
[1]胡雪莹;张越;郭雅杰;仇天雷;高敏;孙兴滨;王旭明-.不同施肥处理农田土壤中噬菌体与细菌携带抗生素抗性基因的比较)[J].生物技术通报,2022(09):116-126
A类：
MLSB
B类：
施肥处理,农田土壤,噬菌体,抗生素抗性基因,antibiotic,resistance,genes,ARGs,土壤细菌,利用微,droplet,digital,ddPCR,整合子,intl1,不施肥,施有机肥,肥土,有机肥施用,化肥施用,多耐药,大环内酯,林肯,阳性菌,菌素,内酰胺,酰胺类,基因丰度,显著优势,blaTEM,冗余分析,营养因子,赋存特征,储存库
AB值：
0.225803
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