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典型文献
实时荧光定量PCR快速鉴别新型冠状病毒主要变异株
文献摘要:
为建立一种快速鉴别严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的5种主要变异株的TaqMan探针实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)体系,基于 SARS-CoV-2 野生型及变异株 alpha(N501Y、HV69-70del)、beta(E484K、K417N)、gamma(K417T、V1176F)、delta(L452R、T478K)和 omicron(H655Y、N679K、P681H)序列设计特异性引物、探针,建立和优化一种鉴别新型冠状病毒(SARS-CoV-2)5种主要变异株的TaqMan探针RT-qPCR方法,并进行该方法的特异性、敏感性、鉴别能力评价.该方法可准确区分出SARS-CoV-2野生型和突变型,与其他呼吸道病原体(n=21)无交叉,显示高特异性.该方法最低检测限为2×102拷贝/mL,操作简单、快速、成本廉价,可用于监测SARS-CoV-2毒株的变异,精准指导疫情识别与防控.
文献关键词:
新型冠状病毒;实时荧光定量PCR;变异株
作者姓名:
韩勇军;刘琪琦
作者机构:
北京工业大学环境与生命学部,北京100124;军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所,北京100850
文献出处:
引用格式:
[1]韩勇军;刘琪琦-.实时荧光定量PCR快速鉴别新型冠状病毒主要变异株)[J].生物工程学报,2022(06):2224-2235
A类:
HV69,70del,K417N,K417T,V1176F,H655Y,N679K,P681H
B类:
快速鉴别,变异株,严重急性呼吸综合征冠状病毒,severe,acute,respiratory,syndrome,coronavirus,SARS,CoV,TaqMan,real,quantitative,qPCR,野生型,alpha,N501Y,beta,E484K,gamma,delta,L452R,T478K,omicron,序列设计,特异性引物,鉴别能力,能力评价,分出,突变型,呼吸道病原体,检测限,拷贝,廉价,毒株,精准指导,识别与防控
AB值:
0.356686
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