提取对伊维菌素敏感及耐药的捻转血矛线虫各50条单条虫体全基因组DNA,PCR扩增耐伊维菌素候选基因HCOI00378500、HCOI00506600和HCOI01200700的目的片段后测序,序列使用Lasergene 7.0软件中的SeqMan程序进行人工校正,采用EditSeq程序截取含有特定单核苷酸多态性(SNP)位点所在编码序列(CDS)区的DNA片段,采用MegAlign程序进行序列比对及单核苷酸和氨基酸多态性分析.结果 显示,25个测序成功的敏感虫株中,HCOI00378500基因所有核苷酸位点无差异;35个测序成功的耐药虫株中,有8个虫株出现了共32个SNP位点,并且导致17个氨基酸突变,其中突变率最高的SNP占8.6％(3/35).测序成功的40个耐药虫株中,HCOI00506600基因CDS区序列第75位碱基均发生突变(T＞C);测序成功的21个敏感虫株中,有7个虫株发生突变(T＞C);氨基酸由异亮氨酸(Ile,Ⅰ)变为苏氨酸(Thr,T).测序成功的38个敏感虫株中,HCOI01200700基因的38、101、125和134位点共有4个SNP;测序成功的13个耐药虫株中,32、48、71、86、101和131等5个位点共有6个SNP.HCOI01200700基因第38位呈G/A多态性(52.6％,20/38),第125位呈T/C多态性(57.9％,22/38),第134位呈C/A多态性(57.9％,22/38),敏感虫株基因中至少有1个38G、125T或134C,耐药虫株基因中均为38A、125C或134A.提示HCOI00506600基因可作为为捻转血矛线虫耐伊维菌素相关候选功能基因,HCO101200700基因可作为伊维菌素耐药性诊断的候选标记分子.

伊维菌素;捻转血矛线虫;耐药性;候选基因;单核苷酸多态性

罗晓平;李军燕;高娃;耿万恒;王瑞;胡薇;乔蕾;邵国玉;杨晓野

内蒙古农业大学兽医学院,呼和浩特010018;内蒙古自治区农牧业科学院兽医研究所,呼和浩特010031;内蒙古大学生命科学学院,呼和浩特010021;兴安盟科尔沁右翼前旗农牧业科学技术发展中心,兴安盟 137400

中国寄生虫学与寄生虫病杂志

[1]罗晓平;李军燕;高娃;耿万恒;王瑞;胡薇;乔蕾;邵国玉;杨晓野-.捻转血矛线虫耐伊维菌素候选基因的多态性分析)[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2022(04):536-539,544

HCOI00378500,HCOI00506600,HCOI01200700,SeqMan,EditSeq,125T,134C,125C,134A,HCO101200700

捻转血矛线虫,伊维菌素,候选基因,多态性分析,单条,虫体,体全,全基因组,后测,Lasergene,截取,定单,单核苷酸多态性,SNP,在编,编码序列,CDS,MegAlign,序列比对,酸位点,氨基酸突变,突变率,碱基,异亮氨酸,Ile,苏氨酸,Thr,个位,38G,38A,功能基因,耐药性,标记分子

0.235089