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典型文献
麦洼牦牛不同生长阶段肝脏差异表达基因分析
文献摘要:
为探讨牦牛肝脏生长过程中基因的表达特征,采用Illumina高通量测序平台(HiSeqTM2500)对1日龄组(LD)、15月龄组(LM)和5岁龄组(LY)的健康麦洼牦牛肝脏进行转录组测序,并以qRT-PCR验证差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的表达量.结果 显示,LD组、LM组和LY组中分别有325个、85个和84个表达水平高于其他两组的显著差异表达基因(P<0.05).在其富集的GO条目和KEGG通路中,分别包含102个、104个和134个显著差异GO条目及19个、13个和19个显著差异KEGG通路(P<0.05).其中占比最多的GO条目为氧化还原相关过程、发育过程和代谢过程,占比最多的KEGG通路为磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B (phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase,PI3K-Akt)信号通路、粘着斑和细胞外基质(extracellular ma-trix,ECM)受体相互作用.qRT-PCR差异验证结果显示,CYP7B1、PGFS2、CYP1A1、UGT2C1-1、UGT2CIL、HSD11B1、CYP2C19、UGT2C1-2基因的表达量变化与转录组测序结果相符.综上表明,本研究为进一步探讨不同生长阶段牦牛肝脏发育提供了有力的实验数据,可为深入理解牦牛肝脏生长发育过程提供参考与借鉴.
文献关键词:
牦牛;生长阶段;肝脏;转录组
作者姓名:
傅芳;王利;字向东
作者机构:
西南民族大学,青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部和四川省重点实验室,成都610041;西南民族大学,动物科学国家民委重点实验室,成都610041
文献出处:
引用格式:
[1]傅芳;王利;字向东-.麦洼牦牛不同生长阶段肝脏差异表达基因分析)[J].兽类学报,2022(01):85-94
A类:
HiSeqTM2500,PGFS2,UGT2C1,UGT2CIL
B类:
麦洼牦牛,生长阶段,差异表达基因分析,牛肝,生长过程,表达特征,Illumina,高通量测序平台,日龄,龄组,LD,月龄,LM,LY,转录组测序,qRT,differentially,expressed,genes,DEGs,条目,氧化还原,关过,代谢过程,磷脂酰肌醇,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,phosphatidylinositol,kinase,protein,PI3K,Akt,粘着,细胞外基质,extracellular,ma,trix,ECM,CYP7B1,CYP1A1,HSD11B1,CYP2C19
AB值:
0.344824
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