典型文献
从头组装豚鹿血液转录组揭示雌雄基因表达差异
文献摘要：
豚鹿Axis porcinus是国家一级重点保护野生动物,为理解其基因表达上的基本特征,本研究采用RNA-seq技术对16个豚鹿血液样本进行了测序和从头组装,一共得到615548条unigenes,Contig N50为803 bp.将组装的转录本进行同源序列比对注释,发现豚鹿血液在信号转导、抗病毒感染和免疫系统等通路上表达的基因最丰富.通过比较雌雄豚鹿的差异表达基因(DEGs),鉴定了1781个在雄性中显著上调和14个显著下调的性别差异表达基因,雄性的高表达DEGs远多于雌性,且主要富集在精子形成、睾丸功能和自身免疫相关通路,暗示雌雄豚鹿在生殖发育和自身免疫方面存在较大差异.部分可能与鹿角生长相关的基因(Rela、ADAMTS2、OLIG1、Snai1、PTH1R、TGFBI、MMP9)均在雄性豚鹿中显著高表达.本研究为丰富豚鹿转录表达提供了基础数据,为进一步深入挖掘豚鹿功能基因、分子标记开发以及鹿角形成机制提供了参考.
文献关键词：
豚鹿;从头组装;血液转录组;性别差异表达
中图分类号：
作者姓名：
刘运;柳方圆;余建秋;牛李丽;刘选珍;李静
作者机构：
四川大学生命科学学院,生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610065;成都动物园,成都野生动物研究所,成都610081
文献出处：
引用格式：
[1]刘运;柳方圆;余建秋;牛李丽;刘选珍;李静-.从头组装豚鹿血液转录组揭示雌雄基因表达差异)[J].四川动物,2022(06):619-627
A类：
豚鹿,porcinus,性别差异表达,ADAMTS2,OLIG1
B类：
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AB值：
0.353492
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