典型文献
林麝FASN基因CDS区克隆及序列分析
文献摘要:
为了解林麝(Moschus berezovskii)脂肪酸合酶(Fatty acid synthase,FASN)基因mRNA序列信息及解析麝香的生物机制,通过转录组测序、Trinity拼接、反转录PCR扩增和Singer测序获取林麝FASN基因mRNA序列,并对FASN蛋白序列进化树构建、二级结构、三级结构、互作蛋白、磷酸化分析及miRNAs结合预测,筛选与麝鼠(Ondatra zibe-thicus)FASN相同且与牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)不同的氨基酸位点作为麝香生物合成有关的关键位点.获取了林麝FASN基因的mRNA序列(Gen-Bank ID:MW570770),其具有一定的物种保守性,筛选出16个关键位点,其中第307、602、657和1334位氨基酸能够改变蛋白羟基活性,预测出10个蛋白磷酸化位点,miR-1307-5p和miR-669与3′-UTR亲和能力较强.林麝FASN基因序列与其他物种之间的差异信息可为解析麝香生物合成机制提供参考.
文献关键词:
林麝;FASN;蛋白序列分析;麝香生物合成;miRNAs
中图分类号:
作者姓名:
谌颖莲;竭航;赵贵军;封孝兰;张承露;吴佳勇;曾德军
作者机构:
重庆市药物种植研究所, 特色生物资源研究与利用川渝共建重点实验室, 重庆, 408435
文献出处:
引用格式:
[1]谌颖莲;竭航;赵贵军;封孝兰;张承露;吴佳勇;曾德军-.林麝FASN基因CDS区克隆及序列分析)[J].野生动物学报,2022(02):370-378
A类:
Ondatra,zibe,thicus,麝香生物合成,MW570770
B类:
林麝,FASN,CDS,Moschus,berezovskii,脂肪酸合酶,Fatty,acid,synthase,序列信息,转录组测序,Trinity,拼接,Singer,进化树构建,二级结构,三级结构,互作蛋白,miRNAs,麝鼠,Bos,taurus,山羊,Capra,hircus,绵羊,Ovis,aries,氨基酸位点,关键位点,Gen,Bank,ID,保守性,变蛋,预测出,蛋白磷酸化,5p,UTR,基因序列,生物合成机制,蛋白序列分析
AB值:
0.413913
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。