典型文献
鸭茅响应水淹胁迫的miRNA差异表达分析
文献摘要：
水淹胁迫是限制我国西南地区鸭茅产量和品质提升的主要环境因子,已经成为一种不容忽视的非生物胁迫.鉴定鸭茅耐涝相关的功能基因,并探究其调控机制是鸭茅种质创新,提高鸭茅耐涝能力的必要途径.以鸭茅耐涝品种"滇北"为试验材料,分别经水淹胁迫处理0、8和24 h后,利用Illumina Hiseq测序平台对鸭茅叶片进行小RNA测序.结果表明,在水淹胁迫处理下共鉴定得到208个差异表达基因(DEGs),经过筛选后有38个基因上调表达,34个基因下调表达,共占差异表达基因的34.62％."滇北"鸭茅在水淹胁迫下差异表达基因主要属于miR166、miR167、miR159、miR396和miR156这5个miRNA基因家族.基于对差异miRNA进行靶基因预测及靶基因的GO和KEGG功能分析,发现这些靶基因主要参与细胞生理过程、代谢过程、IL-17信号通路、Th17细胞分化等植物逆境响应过程,为进一步揭示鸭茅在水淹胁迫下的分子调控机制提供了研究线索.
文献关键词：
鸭茅;水淹胁迫;耐涝;miRNA;差异表达
中图分类号：
作者姓名：
杨兴云;乔丹丹;张雅洁;王少青;任俊才;李明阳;屈明好;尚盼盼;杨成;黄琳凯;曾兵
作者机构：
西南大学动物科学技术学院,重庆402460;草食动物科学重庆市重点实验室,重庆400715;福建傲农生物科技集团股份有限公司,福建 厦门361111;四川农业大学草业科技学院,四川 成都611130
文献出处：
引用格式：
[1]杨兴云;乔丹丹;张雅洁;王少青;任俊才;李明阳;屈明好;尚盼盼;杨成;黄琳凯;曾兵-.鸭茅响应水淹胁迫的miRNA差异表达分析)[J].草业学报,2022(06):150-162
A类：
miR167
B类：
鸭茅,水淹胁迫,miRNA,差异表达分析,西南地区,产量和品质,品质提升,环境因子,非生物胁迫,耐涝,功能基因,种质创新,滇北,经水,胁迫处理,Illumina,Hiseq,测序平台,差异表达基因,DEGs,过筛,miR166,miR159,miR396,miR156,基因家族,靶基因预测,功能分析,细胞生理过程,代谢过程,Th17,细胞分化,逆境响应,响应过程,分子调控机制
AB值：
0.330292
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