FAILED
首站-论文投稿智能助手
典型文献
'横冲89'油茶转录组及光合油脂代谢途径基因表达分析
文献摘要:
[目的]为揭示油茶基因的生物学功能及品种遗传改良提供参考.[方法]以优良油茶品种'横冲89'为研究对象,采集叶、花芽、雄蕊、雌蕊、子房、成熟种子,提取总RNA,其中,以花芽、雄蕊、雌蕊、子房总RNA的混合样构建花的转录组.用磁珠分离富集mRNA,利用Illumina RNA-seq高通量测序技术构建油茶叶、花和成熟种子的转录组,利用NCBI、SwissProt、Nr蛋白数据库与GO、KEGG、KOG数据库对这3个转录组中的Unigene进行注释和分类,分析这些转录组中参与糖代谢、能量代谢、脂质代谢途径的Unigene,并进行KEGG通路的富集分析,比较光合作用、脂肪酸合成途径中基因的转录表达.[结果]构建了油茶叶、花、种子转录组文库,在这些转录组中包括6.652×107条净读长序列,82964个Unigene,185190个转录本.其中,Unigene和转录本的平均长度分别为671、966 bp.这些Unigenes与NCBI、SwissProt数据库基因的相似性约为46.51%,与Nr蛋白数据的相似性为53.49%;对82994条组装Unigene进行GO分类,其中24313条Unigene与KEGG 31个代谢途径相匹配,35773条Unigene与KOG 26个代谢途径匹配.此外,在上述代谢途径中发现光合作用关键酶Rubisco、脂肪酸合成关键酶ACCase存在同源基因,并且发现叶绿素a/b结合蛋白4、脂肪酸合成酶、类脂肪酸合成酶异构体、乙醇脱氢酶等基因在叶、花、种子中差异表达.[结论]油茶叶、花、种子转录组中的Unigene参与糖代谢、能量代谢、油脂代谢途径,在光合作用及油脂合成过程中差异表达并发挥重要作用.
文献关键词:
油茶;转录组测序;代谢途径;基因表达
作者姓名:
王保明;颜士华;王胜清;陈永忠;商建波
作者机构:
湖南应用技术学院 农林科技学院,湖南 常德 415000;临沂科技职业学院 现代农业系,山东 临沂 276000;湖南省林业科学院 国家油茶研究工程中心,湖南 长沙 410004
文献出处:
引用格式:
[1]王保明;颜士华;王胜清;陈永忠;商建波-.'横冲89'油茶转录组及光合油脂代谢途径基因表达分析)[J].经济林研究,2022(02):31-39
A类:
B类:
横冲,合油,油脂代谢途径,基因表达分析,生物学功能,遗传改良,油茶品种,花芽,雄蕊,雌蕊,子房,磁珠分离,分离富集,Illumina,seq,高通量测序技术,技术构建,茶叶,NCBI,SwissProt,Nr,KOG,糖代谢,能量代谢,脂质代谢,富集分析,光合作用,脂肪酸合成途径,转录表达,文库,转录本,平均长度,bp,Unigenes,Rubisco,合成关键酶,ACCase,同源基因,叶绿素,结合蛋白,脂肪酸合成酶,类脂,异构体,乙醇脱氢酶,差异表达,油脂合成,合成过程,转录组测序
AB值:
0.30119
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。