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大蒜几丁质酶基因AsCHI1的鉴定及其对盐胁迫的响应
文献摘要：
本研究旨在研究大蒜几丁质酶基因的序列特征及其对盐胁迫的响应,鉴定其抗逆功能.以大蒜品种'苍山四六瓣'为研究材料,通过RT-PCR技术分离得到AsCHI1基因.采用BioXM 2.6、ProtParam、DNAMAN、SignalP 5.0、SOPMA、SWISS-MODEL、NCBI和MEGA5等软件分析核苷酸及其编码的氨基酸序列特征,利用荧光定量PCR技术检测其在不同组织以及盐胁迫下的表达特性.该基因开放阅读框全长933 bp,编码310个氨基酸,其编码的蛋白属于几丁质酶Class Ⅰ类,同时隶属于GH19家族成员.氨基酸序列分析显示,AsCHI1在N端含有大多数几丁质酶具备的信号肽区域,在C端与其他物种CHI氨基酸序列一致性较高.在亲缘关系上与同属百合科的麝香百合LlCHI (QBZ68892.1)以及山荼科的茶CsCHI(XP_028075045.1)较为接近.实时荧光定量PCR技术分析表明,AsCHI1基因在大蒜根、蒜瓣和叶片中均有表达,但在根中表达最高.另外,盐胁迫能显著诱导AsCHI1基因在各组织内的表达.说明该基因可能在大蒜植株抵御盐胁迫的过程中发挥重要作用.
文献关键词：
大蒜;盐胁迫;AsCHI1基因;基因克隆;响应
中图分类号：
作者姓名：
张宇阳;周雪;刘灵艺;许吴俊;任旭琴;王广龙;熊爱生
作者机构：
淮阴工学院生命科学与食品工程学院,江苏淮安223003;淮阴工学院应用技术学院,江苏淮安223003;南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,南京210095
文献出处：
引用格式：
[1]张宇阳;周雪;刘灵艺;许吴俊;任旭琴;王广龙;熊爱生-.大蒜几丁质酶基因AsCHI1的鉴定及其对盐胁迫的响应)[J].中国农学通报,2022(05):23-29
A类：
AsCHI1,BioXM,LlCHI,QBZ68892,CsCHI
B类：
几丁质酶基因,盐胁迫,序列特征,抗逆功能,大蒜品种,苍山,四六,六瓣,ProtParam,DNAMAN,SignalP,SOPMA,SWISS,MODEL,NCBI,MEGA5,氨基酸序列,不同组织,表达特性,开放阅读框,全长,bp,Class,隶属于,GH19,序列分析,信号肽,序列一致性,亲缘关系,系上,同属,百合科,麝香,XP,蒜瓣,植株,基因克隆
AB值：
0.342601
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