典型文献
甜菜M14品系BvM14-UNG基因克隆及生物信息学分析
文献摘要：
为研究Bv-UNG蛋白在植物碱基切除修复(base-excision repair,BER)途径中的功能,以甜菜M14品系为材料,根据NCBI上二倍体栽培甜菜UDG编码基因Bv-UNG序列,利用同源序列克隆法获得甜菜M14品系BvM14-UNG基因cDNA全长,并对其进行生物信息学分析.结果 表明,该基因编码374个氨基酸,BvM14-UNG蛋白表现出较强的亲水性,为可溶性蛋白,主要由无规卷曲和α螺旋构成,具有水激活基序、尿嘧啶结合基序、小沟插入环基序、尿嘧啶糖基化酶抑制剂(uracil glycosylase inhibitor,UGI)结合位点和亮氨酸(Leu)位点,属于UDG-F1亚家族,BvM14-UNG蛋白与甜菜BvUNG蛋白亲缘性最近,其次为藜麦CqUNG蛋白.本研究可为后续开展甜菜M14品系BER途径中BvM14-UNG酶活性研究提供参考.
文献关键词：
甜菜M14品系;BvM14-UNG基因;碱基切除修复;基因克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
王盛昊;于冰
作者机构：
黑龙江大学农业微生物技术教育部工程研究中心,哈尔滨150500;黑龙江大学生命科学学院/黑龙江省普通高校分子生物学重点实验室,哈尔滨150080
文献出处：
引用格式：
[1]王盛昊;于冰-.甜菜M14品系BvM14-UNG基因克隆及生物信息学分析)[J].中国农学通报,2022(04):16-22
A类：
BvM14,UDG,BvUNG,CqUNG
B类：
甜菜,品系,基因克隆,生物信息学分析,碱基切除修复,base,excision,repair,BER,NCBI,二倍体,编码基因,列克,cDNA,全长,基因编码,亲水性,可溶性蛋白,无规,卷曲,基序,尿嘧啶,小沟,糖基化,酶抑制剂,uracil,glycosylase,inhibitor,UGI,结合位点,亮氨酸,Leu,亚家族,亲缘性,藜麦,活性研究
AB值：
0.274278
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