典型文献
运用网络药理学和分子对接技术探究氧化苦参碱治疗骨关节炎的作用机制
文献摘要：
目的:运用网络药理学和分子对接探究氧化苦参碱(oxymatrine,OM)治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的作用机制.方法:采用数据库平台Pharm Mapper和TCMSP预测OM的目标靶点,以"osteoarthritis"为关键词通过OMIM及Gene cards数据库平台检索OA相关基因,通过Venn图交集筛选出OM治疗OA的靶点;基于数据库平台STRING 10.0获取蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络并筛选核心靶点,利用David V 6.7在线网络平台进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,运用Cytoscape 3.7.1软件构建交集基因-GO-KEGG网络,最后借助Discovery Studio 2019将OM与核心靶点进行分子对接验证.结果:共得到OM治疗OA的交集靶点80个,筛选出5个核心靶点:AKT1、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、SRC、MYC和肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF).GO富集分析共得到119个条目,KEGG富集分析共得到129 条通路,通过 P 值排序筛选出 5 条治疗 OA 的通路,分别是 proteoglycans in cancer、PI3K-Akt signaling pathway、Lipid and atherosclerosis、MAPK signaling pathway、Chemical carcinogenesis receptor activation、Prostate cancer,OM 分别对接 5 个核心靶点的Libdockscore均高于92.结论:OM可稳定作用于多个靶点并激活多条通路干预OA.
文献关键词：
骨关节炎;氧化苦参碱;分子对接;网络药理学
中图分类号：
作者姓名：
叶柏柏;林城;王心宁;常征辉;李林福
作者机构：
赣南医学院,江西赣州 341000;河南中医药大学,河南郑州 450046
文献出处：
引用格式：
[1]叶柏柏;林城;王心宁;常征辉;李林福-.运用网络药理学和分子对接技术探究氧化苦参碱治疗骨关节炎的作用机制)[J].河南中医,2022(09):1364-1369
A类：
Libdockscore
B类：
网络药理学,分子对接技术,技术探究,氧化苦参碱,骨关节炎,oxymatrine,osteoarthritis,OA,Pharm,Mapper,TCMSP,标靶点,OMIM,Gene,cards,Venn,STRING,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,核心靶点,David,在线网络,基因本体,ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,encyclopedia,genomes,通路富集分析,Cytoscape,软件构建,建交,Discovery,Studio,交集靶点,AKT1,interleukin,SRC,MYC,tumor,necrosis,条目,proteoglycans,cancer,PI3K,Akt,signaling,pathway,Lipid,atherosclerosis,MAPK,Chemical,carcinogenesis,receptor,activation,Prostate,稳定作用,多条
AB值：
0.399363
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