目的 了解贵州省鼠伤寒沙门菌单相变异株规律的成簇间隔短回文重复序列(CRISPR)的基因型及遗传多样性,为贵州省沙门菌病的预防控制提供依据.方法 对分离 自2013-2018年贵州省7个市(州)的71株疑似鼠伤寒沙门菌单相变异株进行系统生化鉴定及血清分型,结合双重PCR法确定疑似菌株为鼠伤寒沙门菌单相变异株.提取鼠伤寒沙门菌单相变异株的DNA作为模板,进行CRISPR1和CRISPR2的PCR扩增,将阳性扩增产物进一步测序,获得菌株的CRISPR1和CRISPR2间隔序列,根据间隔序列的组成,确定CRISPR基因型,并使用Bionumerics软件对菌株进行遗传多样性分析.结果 71株疑似鼠伤寒沙门菌单相变异菌株经系统生化鉴定、血清分型及双重PCR法鉴定为鼠伤寒沙门菌单相变异株,经CRISPR1和CRISPR2两个位点的PCR扩增和产物测序,71株菌共检测到163个间隔序列,其中CRISPR1有102个,CRISPR2有61个.联合CRISPR1和CRISPR2两个位点的间隔序列进行分析,发现71株菌被分为33个CRISPR基因型(TSTs),其中TST11和TST1为贵州省的优势基因型,分别占总菌株数的25.35％和12.68％.71株菌经Bionumerics软件聚类分析后被分为A、B、C、D 4个簇,A簇包含的菌株最多,B簇包含的基因型最多,不同来源的3株参考株独立成簇,D簇包含7个TSTs基因型.结论 贵州省鼠伤寒沙门菌单相变异株具有优势的CRISPR基因型和遗传多样性的特点,可能有其他的感染来源.

鼠伤寒沙门菌单相变异株;CRISPR;基因型;遗传多样性

白贵欢;游旅;龙利;牟鸿江;韦小瑜;李世军;王铭;刘英;刘淳婷;王丹;汪俊华

贵州医科大学公共卫生与健康学院,环境污染与疾病监控教育部重点实验室,贵阳 550025;贵州省疾病预防控制中心,贵阳 550004

中国人兽共患病学报

[1]白贵欢;游旅;龙利;牟鸿江;韦小瑜;李世军;王铭;刘英;刘淳婷;王丹;汪俊华-.贵州省鼠伤寒沙门菌单相变异株的CRISPR基因型和遗传多样性研究)[J].中国人兽共患病学报,2022(10):862-868,873

鼠伤寒沙门菌单相变异株,CRISPR2,TSTs,TST11,TST1

基因型,多样性研究,回文,重复序列,沙门菌病,预防控制,生化鉴定,血清分型,CRISPR1,扩增产物,步测,间隔序列,Bionumerics,遗传多样性分析,变异菌株,个位,株数,不同来源,立成,感染来源

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