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结核分枝杆菌McSpoligotyping基因分型在宜昌地区耐多药结核病中的应用研究
文献摘要：
目的 运用熔解曲线间隔区寡核苷酸分型(melting curve spacer oligonucleotide typing,McSpoligotyping)方法对宜昌地区耐多药结核分枝杆菌进行基因分型,以评价其在结核病流行病学调查中的应用价值.方法 选择2019年1月—2020年12月耐多药菌株77株作为实验组,并以异烟肼和利福平敏感菌株110株作为对照组,运用McSpoligotyping方法进行基因分型,将分型结果与SpolDB4.0数据库进行比对分析.结果 187株菌株中北京基因型116株(62.03％),非北京基因型71株(37.97％).对照组110株中北京基因型60株(54.55％),其中数量最多的1组国际型别编码(spoligotype inter-national type,SIT)为1的北京基因型共44株(40.00％);非北京基因型50株(45.45％),以T族、Manu族常见.实验组77株中北京基因型56株(72.73％),其中数量最多的1组为SIT为1的北京基因型共44株(57.14％),非北京基因型21株(27.27％),以T族、Manu2族常见.实验组北京基因型菌株所占比例与对照组差异有统计学意义.实验组成簇率(79.22％)与对照组成簇率(79.09％)差异无统计学意义.结论 北京基因型菌株是宜昌地区结核病的主要流行菌株,在耐多药结核病患者中北京基因型菌株更为流行.耐多药结核菌株有一定的遗传多态性.McSpoligotyping方法操作简单、快速、对于结核病分子流行病学研究具有重要意义.
文献关键词：
结核分枝杆菌;北京基因型;熔解曲线;间隔区寡核苷酸分型法;分子流行病学;耐多药结核病;异烟肼;利福平;成簇炎
中图分类号：
作者姓名：
何建;胡晓红;周萍;胡芳;刘鹏;周小妮
作者机构：
443003,宜昌市第三人民医院结核科;443003,宜昌市第三人民医院检验科;443005,宜昌市疾病控制中心结防所
文献出处：
引用格式：
[1]何建;胡晓红;周萍;胡芳;刘鹏;周小妮-.结核分枝杆菌McSpoligotyping基因分型在宜昌地区耐多药结核病中的应用研究)[J].传染病信息,2022(06):538-543
A类：
McSpoligotyping,间隔区寡核苷酸分型,SpolDB4,spoligotype,Manu,Manu2,间隔区寡核苷酸分型法,成簇炎
B类：
结核分枝杆菌,基因分型,宜昌地区,耐多药结核病,熔解曲线,线间,melting,curve,spacer,oligonucleotide,流行病学调查,调查中,异烟肼,利福平,比对分析,中北,非北京基因型,国际型,型别,inter,national,SIT,流行菌株,结核菌,遗传多态性,分子流行病学,流行病学研究
AB值：
0.160333
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