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鼠疫多重荧光定量PCR内标检测方法的建立与应用评价
文献摘要:
目的 建立一种鼠疫多重荧光定量PCR内标检测方法,并进行应用效果评价.方法 选择鼠疫菌染色体YPO0393基因与pMT1质粒caf1基因为靶基因,设计合成YPO0393-内标模板、特异性引物和TaqMan荧光探针,构建鼠疫多重荧光定量PCR内标检测体系;对非鼠疫菌DNA、不同稀释浓度鼠疫菌DNA、野外监测样本进行检测,评价该方法的特异性、灵敏性、重复性和应用效果.结果 采用多重荧光定量PCR内标方法,8株鼠疫菌DNA均出现明显的扩增曲线,12株非鼠疫菌DNA未显示扩增曲线,提示该方法特异性良好.不同浓度的鼠疫EV76疫苗株DNA,检测最低限为22.5×10-4 ng/μL,变异系数为0.99~3.42,提示灵敏性、重复性较好.105份野外监测样本中,荧光定量PCR内标方法检测阳性的6份,与普通PCR方法检测结果一致,4份样本分离培养出鼠疫菌且采用PCR方法检测阳性.结论 通过设置双靶基因与内标对照,本研究建立的鼠疫多重荧光定量PCR内标方法可降低检测假阳性率,特异性、灵敏性和重复性理想,可用于鼠疫快速检测.
文献关键词:
鼠疫耶尔森菌;多重荧光定量PCR方法;内标对照;评价
中图分类号:
作者姓名:
李博;崔燕;安静;古丽阿依·包开西;罗勇军;王信惠;黎唯;王效俊
作者机构:
新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心,新疆乌鲁木齐830001;新疆农业科学院,新疆乌鲁木齐830091
文献出处:
引用格式:
[1]李博;崔燕;安静;古丽阿依·包开西;罗勇军;王信惠;黎唯;王效俊-.鼠疫多重荧光定量PCR内标检测方法的建立与应用评价)[J].疾病监测,2022(05):657-660
A类:
建立与应用评价,YPO0393,pMT1,caf1,内标对照
B类:
应用效果评价,鼠疫菌,质粒,靶基因,设计合成,特异性引物,TaqMan,荧光探针,检测体系,稀释浓度,野外监测,灵敏性,法特,EV76,疫苗株,最低限,分离培养,假阳性率,快速检测,鼠疫耶尔森菌
AB值:
0.185969
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