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屎肠球菌自溶的基因表达差异分析
文献摘要：
为探讨屎肠球菌自溶状态下基因表达变化,利用高通量测序技术进行RNA-Seq分析.差异基因分析显示,自溶状态下共有783个基因表达出现差异,其中在自溶状态下上调和下调的基因分别为689和94个.GO功能聚类分析显示,差异基因主要富集在细胞、细胞组分、生物合成、有机物质生物合成几个方面.KEGG富集分析发现,差异基因主要参与了核糖体、氨基酰基-tRNA生物合成、嘌呤代谢、肽聚糖生物合成、嘧啶代谢、同源重组、氨基酸合成等通路,且下调的差异基因主要富集在碳代谢、糖酵解/糖异生、丙酮酸代谢等能量代谢相关通路.说明屎肠球菌自溶状态下代谢出现了明显改变,对碳源的利用不足和合成能力的下降可能是导致屎肠球菌自溶发生的重要原因.通过分析屎肠球菌自溶状态下基因的表达情况,得到了充分的基因数据,为进一步研究屎肠球菌的自溶发生机制提供了基础.
文献关键词：
屎肠球菌;自溶;转录组;差异表达基因;GO功能
中图分类号：
作者姓名：
聂俊辉;郭浩;王通;郭建军;曾静;袁林
作者机构：
江西省科学院微生物研究所,江西南昌 330096;上饶市农林水科学研究中心,江西上饶 334000;江西鑫维生物技术有限公司,江西南昌 330096
文献出处：
引用格式：
[1]聂俊辉;郭浩;王通;郭建军;曾静;袁林-.屎肠球菌自溶的基因表达差异分析)[J].中国饲料,2022(23):32-39
A类：
B类：
屎肠球菌,自溶,基因表达差异,表达变化,高通量测序技术,Seq,差异基因分析,生物合成,富集分析,核糖体,酰基,tRNA,嘌呤代谢,肽聚糖,嘧啶,同源重组,氨基酸合成,碳代谢,糖酵解,糖异生,丙酮酸代谢,能量代谢,相关通路,下代,碳源,合成能力,基因数据,发生机制,转录组,差异表达基因
AB值：
0.301017
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