典型文献
基于网络药理学和体外细胞实验探讨芍药甘草汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制
文献摘要:
目的:利用网络药理学、差异基因分析、分子对接技术和体外细胞实验,探究芍药甘草汤(SYGCD)治疗溃疡性结肠炎(UC)的初步作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)和文献检索,获取SYGCD中白芍和甘草的活性成分和作用靶点.从基因表达综合(GEO)数据库中筛选获得GSE47908芯片数据,绘制差异基因热图和火山图.运用Cytoscape软件构建SYGCD治疗UC分子基因网络图,借助Bisogenet和CytoNCA绘制核心靶点拓扑网络,使用R 3.6.3软件对差异基因进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析.采用分子对接解析活性成分与关键靶点的相互作用.采用RAW264.7巨噬细胞,通过MTT实验和RT-qPCR实验初步验证SYGCD的抗炎作用的相关靶点.结果:①获得SYGCD治疗UC的102个活性成分,主要为槲皮素、山奈酚、异鼠李素等,拓扑网络筛选出关键候选基因为过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、诱导型一氧化氮合酶(NOS2)等.富集分析显示,与UC治疗相关的信号通路主要为白介素(IL)-17信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等.②分子对接结果显示,SYGCD中核心成分与关键靶点均能通过氢键结合.③MTT实验结果显示,SYGCD对RAW264.7细胞几乎没有毒性;RT-qPCR结果显示,SYGCD能降低RAW264.7细胞炎症模型中细胞因子TNF-α、IL-1β和IL-6mRNA表达水平.结论:SYGCD治疗UC具有多成分、多靶点、多途径等特征,作用机制可能是SYGCD中的槲皮素、山奈酚、芒柄花素、异鼠李素等活性成分作用于PPARγ、NOS2、IL-1β等靶点,调控IL-17、TNF、NF-κB等信号通路发挥治疗UC的作用;且SYGCD可通过调节促炎性细胞因子TNF-α、IL-1β和IL-6发挥抗炎效果.
文献关键词:
芍药甘草汤;溃疡性结肠炎;网络药理学;GEO芯片;分子对接;体外细胞实验
中图分类号:
作者姓名:
何毅豪;王冰;杨骏;张彤
作者机构:
上海中医药大学中药学院 上海 201203;中国科学院上海药物研究所药物制剂研究中心 上海 201203;上海市黄浦区香山中医医院 上海 200020
文献出处:
引用格式:
[1]何毅豪;王冰;杨骏;张彤-.基于网络药理学和体外细胞实验探讨芍药甘草汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制)[J].上海中医药大学学报,2022(06):59-69
A类:
SYGCD,GSE47908
B类:
网络药理学,体外细胞实验,芍药甘草汤,溃疡性结肠炎,利用网络,差异基因分析,分子对接技术,UC,系统药理学,药理学分析,分析平台,TCMSP,文献检索,白芍,活性成分,作用靶点,GEO,热图,火山图,Cytoscape,软件构建,分子基因,网络图,Bisogenet,CytoNCA,核心靶点,拓扑网络,功能富集分析,通路富集分析,关键靶点,RAW264,巨噬细胞,MTT,qPCR,抗炎作用,槲皮素,山奈酚,异鼠李素,候选基因,过氧化物酶体增殖物激活受体,PPAR,诱导型一氧化氮合酶,NOS2,白介素,核心成分,氢键,有毒,细胞炎症模型,6mRNA,多成分,多靶点,多途径,芒柄花素,成分作用,促炎性细胞因子,抗炎效果
AB值:
0.257579
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