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溃疡性结肠炎相关性结肠癌与偶发性结直肠癌的差异基因分析
文献摘要：
目的 基于GEO数据库查找溃疡性结肠炎相关性结肠癌与偶发性结直肠癌的数据集,得到差异基因,分析其对预后的影响,为肿瘤的个体化治疗寻求方法.方法 通过GEO数据库下载两种类型肿瘤数据集,然后导入R 4.0.3软件,获得表达矩阵,分析差异基因,并进行GO和KEGG分析,采用STRING数据库和Cytoscape软件分析蛋白质相互作用,识别中枢基因.GEPIA网站验证中枢基因是否具有表达差异以及对预后的影响.结果 溃疡性结肠炎相关性结肠癌和偶发性结直肠癌共筛选出上调基因396个,下调基因141个.蛋白质相互作用网络中筛选出10个关联度较高的中枢基因,其中CCL4、CCL2、IL1B、ITGAM基因的表达与预后有关.结论 溃疡性结肠炎相关性结肠癌与偶发性结直肠癌差异基因中CCL4、CCL2、ITGAM对预后影响明显,IL1B基因的表达与预后相关.
文献关键词：
生物信息学;GEO;溃疡性结肠炎相关性结肠癌;中枢基因
中图分类号：
作者姓名：
郭跃;王少波;曾昊;庞志刚
作者机构：
郑州大学第二附属医院普通外科,河南 郑州 450000
文献出处：
引用格式：
[1]郭跃;王少波;曾昊;庞志刚-.溃疡性结肠炎相关性结肠癌与偶发性结直肠癌的差异基因分析)[J].中国现代医药杂志,2022(05):10-14
A类：
溃疡性结肠炎相关性结肠癌
B类：
偶发性,结直肠癌,差异基因分析,GEO,个体化治疗,下载,STRING,Cytoscape,中枢基因,GEPIA,表达差异,出上,蛋白质相互作用网络,CCL4,CCL2,IL1B,ITGAM,预后影响
AB值：
0.14739
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