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典型文献
脓毒症相关性脑病差异基因以及发病机制的数据分析
文献摘要:
目的:探讨脓毒症相关性脑病(sepsis-associated encephalopathy, SAE)的相关差异表达基因(differentially expressed gene, DEG)和信号转导途径。方法:基于基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)的脓毒症患者脑组织的基因组数据,采用基因本体(gene ontology, GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析,以及蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)分析,确定SAE的DEG。结果:DEG在免疫应答、炎症反应、凋亡过程的负调控、蛋白质水解等方面显著富集。通过PPI分析筛选出10个枢纽基因,包括固醇调节元件结合转录因子1(sterol regulatory element binding transcription factor 1, SREBF1)、细胞因子信号转导抑制因子-3(suppressor of cytokine signaling 3, SOCS3)、封闭蛋白5(claudin 5, CLDN5)、免疫球蛋白结构域蛋白4(V-set and immunoglobulin domain containing 4, VSIG4)、DNA损伤诱导蛋白45β(growth arrest and DNA damage inducible protein 45β, GADD45β)、细胞间黏附分子-1(intercellular adhesion molecule 1, ICAM1)、血管生成素-2基因(angiopoietin 2, ANGPT2)、CD14、CD163、血栓反应蛋白1(thrombospondin 1, THBS1)。结论:通过生物信息学方法挖掘出与SAE相关的10个枢纽基因,这些基因和机体的免疫炎症相关。
文献关键词:
脓毒症;脑病;基因;计算生物学;免疫炎症
作者姓名:
林桦;刘鹏;宋程程;秦超;于泳浩
作者机构:
天津医科大学总医院麻醉科,天津 300052;天津医科大学总医院空港医院麻醉科,天津 300300;天津医科大学总医院普通外科,天津 300052
引用格式:
[1]林桦;刘鹏;宋程程;秦超;于泳浩-.脓毒症相关性脑病差异基因以及发病机制的数据分析)[J].国际麻醉学与复苏杂志,2022(10):1050-1053
A类:
ANGPT2
B类:
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AB值:
0.509633
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