典型文献
大鼠神经病理性痛关键基因的筛选
文献摘要:
目的:筛选大鼠神经病理性痛的关键基因。方法:在美国生物技术信息中心的基因表达数据库中,下载大鼠神经病理性痛脊髓组织的基因组数据(GSE18803),确定神经病理性痛相关的差异表达基因,进一步分析蛋白质相互作用网络得到关键基因。通过Tabula Muris数据库对关键基因进行免疫炎症单细胞分布和表达情况的分析。结果:蛋白质相互作用网络得到10个关键基因,包括
Tyrobp、
Clec4a3、
C1qc、
Ptprc、
Laptm5、
Csf1r、
C1qa、
C1qb、
Fcgr3a和
Cd53。
Cd53、
Laptm5和
Ptprc主要在巨噬细胞、B细胞、NK细胞、单核细胞和粒细胞中存在表达;
Clec4a3和
Csf1r主要在单核细胞中表达,
Fcgr3a主要在单核细胞和粒细胞中存在表达;
Tyrobp主要在巨噬细胞、单核细胞、粒细胞和多能祖细胞中存在表达。
结论:通过生物信息学方法筛选出大鼠神经病理性痛相关的10个关键基因,并获得了其在脊髓免疫炎症细胞中的分布和表达情况。
文献关键词:
神经痛;基因;计算生物学
中图分类号:
作者姓名:
林桦;宋程程;秦超;谢克亮;王国林;于泳浩
作者机构:
天津医科大学总医院麻醉科,天津 300041;天津医科大学总医院空港医院,天津 300300
文献出处:
引用格式:
[1]林桦;宋程程;秦超;谢克亮;王国林;于泳浩-.大鼠神经病理性痛关键基因的筛选)[J].中华麻醉学杂志,2022(06):704-707
A类:
GSE18803,Tabula,Muris,Clec4a3,C1qc,Ptprc,Laptm5,Csf1r,C1qa,C1qb,Fcgr3a,Cd53
B类:
神经病理性痛,关键基因,生物技术,信息中心,基因表达数据库,下载,脊髓,基因组数据,定神,差异表达基因,蛋白质相互作用网络,免疫炎症,单细胞,Tyrobp,巨噬细胞,NK,单核细胞,祖细胞,生物信息学方法,炎症细胞,神经痛,计算生物学
AB值:
0.15985
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。