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pre-CTXφ噬菌体在霍乱弧菌基因组中的遗传多样性研究
文献摘要：
溶原性噬菌体CTXφ携带的ctxAB基因是霍乱弧菌产毒株最主要的毒力基因,而pre-CTXφ作为CTXφ的前体,缺失ctxAB基因编码序列.基因组中整合了 pre-CTXφ噬菌体的霍乱弧菌非产毒株,可通过其携带的zot和ace基因,引起患者轻度至中度的霍乱样腹泻症状,存在公共卫生风险.本研究收集了公开发表的1 649株霍乱弧菌草图序列和43株完成图序列,使用比较基因组学和群体遗传学方法,对上述霍乱弧菌数据集进行综合分析,结果表明:不同谱系霍乱弧菌基因组中pre-CTXφ的拷贝数存在差异;其中L3b.4菌株中pre-CTXφ拷贝数呈现随分离年份增加的趋势.L2、L4、L7和L3b谱系存在pre-CTXφ与CTXφ共整合的现象,并发现pre-CTXφ位于pre-CTXφ/CTXφ噬菌体家族系统发育树的祖先位置.这些发现进一步丰富了对霍乱弧菌基因组中pre-CTXφ/CTXφ噬菌体家族遗传多样性的认识,为阐明其整合机制和进化规律提供了必要基础,并为携带此类噬菌体霍乱弧菌的检测及防控提供借鉴.
文献关键词：
霍乱弧菌;pre-CTXφ;拷贝数变异;细菌基因组;噬菌体;毒力因子
中图分类号：
作者姓名：
郝彤宇;马嘉嘉;武雅蓉;钱修伟;张湘莉兰;崔玉军
作者机构：
安徽医科大学基础医学院,安徽合肥230000;军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所,北京100071;解放军总医院京南医疗区复兴路门诊部,北京100851
文献出处：
引用格式：
[1]郝彤宇;马嘉嘉;武雅蓉;钱修伟;张湘莉兰;崔玉军-.pre-CTXφ噬菌体在霍乱弧菌基因组中的遗传多样性研究)[J].疾病监测,2022(11):1402-1407
A类：
zot,L3b
B类：
pre,CTX,霍乱弧菌,遗传多样性,多样性研究,溶原性噬菌体,ctxAB,毒株,毒力基因,基因编码,编码序列,ace,腹泻症状,公共卫生风险,菌草,草图,图序列,成图,比较基因组学,群体遗传学,L2,L4,L7,族系,系统发育树,祖先,整合机制,进化规律,拷贝数变异,细菌基因组,毒力因子
AB值：
0.25105
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