典型文献
辽宁乡土杨树重测序遗传进化全基因组关联分析
文献摘要：
为揭示辽宁省乡土杨树遗传进化和多样性,该文对辽宁省主要乡土杨树14个样品进行重测序,开展了遗传进化全基因组关联分析和数据评估.本次分析数据量为75.57 Gbp的Clean Data,Q30达到 93.77％.测序数据质量质控以及与参考基因组对比统计结果显示:与参考基因组平均比对率为96.72％,基因组覆盖深度为84.92％(至少一个碱基覆盖),平均覆盖深度为10X.通过样品的SNP和InDel的检测和注释,进行了遗传进化和遗传多样性分析,并对乡土杨树群体进行了评价.从系统发育变异检测结果看,白杨派发育早,与黑杨派、青杨派在系统发育中亲缘关系较远,青杨派种间有基因交流现象.该项研究为乡土杨树资源保护和利用提供参考.
文献关键词：
乡土杨树;遗传进化;全基因组关联分析
中图分类号：
作者姓名：
蔄胜军;冯连荣;刘巍;尹杰;林晓峰;倪鹏跃;安云全
作者机构：
辽宁省杨树研究所,辽宁盖州 115200;辽宁省实验林场,辽宁抚顺 113311
文献出处：
引用格式：
[1]蔄胜军;冯连荣;刘巍;尹杰;林晓峰;倪鹏跃;安云全-.辽宁乡土杨树重测序遗传进化全基因组关联分析)[J].辽宁林业科技,2022(06):1-7,40
A类：
Gbp,青杨派
B类：
宁乡,乡土杨树,重测序,遗传进化,全基因组关联分析,数据评估,数据量,Clean,Data,Q30,序数,数据质量,质控,参考基因,覆盖深度,碱基,10X,SNP,InDel,遗传多样性分析,系统发育,变异检测,白杨,派发,黑杨派,亲缘关系,较远,种间,基因交流,资源保护,保护和利用
AB值：
0.313755
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
