典型文献
不停跳冠脉搭桥术后差异基因的生信分析
文献摘要:
目的 通过生信分析探讨不停跳冠脉搭桥(OPCAB)术后基因变化,并筛选关键(Hub)基因.方法 通过纳入数据集GSE12485(心肌)和GSE4386(心房),使用R包对OPCAB术前术后心脏组织进行差异分析,筛选差异基因(DEGs).两组DEGs交集得到共同DEGs进一步分析,然后进行GO和KEGG功能富集分析.最后使用STRING进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,通过Cytoscape软件中cytoHubba的Degree算法筛选Hub基因.结果 共获得36个共同上调DEGs.GO和KEGG分析结果显示,OPCAB术后主要与炎症反应相关.PPI网络分析,并得到4个Hub基因.结论 炎症反应在OPCAB术后起重要作用,而4个Hub基因均具有重要的价值,将为后续研究提供依据.
文献关键词:
不停跳冠脉搭桥;生信分析;差异基因
中图分类号:
作者姓名:
陈远翔;林斌;陈东杰;林先东;翁国星
作者机构:
福建医科大学省立临床医学院福建省立医院心血管外科 福州350001
文献出处:
引用格式:
[1]陈远翔;林斌;陈东杰;林先东;翁国星-.不停跳冠脉搭桥术后差异基因的生信分析)[J].福建医药杂志,2022(06):6-8
A类:
GSE12485,GSE4386
B类:
不停跳冠脉搭桥术,差异基因,生信分析,OPCAB,选关,心房,后心,心脏组织,DEGs,交集,功能富集分析,STRING,蛋白质相互作用,PPI,Cytoscape,cytoHubba,Degree,共获,同上,后主
AB值:
0.218105
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