典型文献
不明原因复发性流产患者的基因表达谱亚组分析
文献摘要：
目的 探讨不明原因的复发性流产(RSA)患者的基因表达谱的异质性,确定亚组子宫内膜生物学过程的区别.方法 从GEO数据库中获取GSE165004和GSE26787基因表达序列,应用ComBat方法去除批次效应后,应用Consensus Cluste-ring方法对29个病例组进行无监督聚类并分成3个亚组(RSA1、RSA2、RSA3),3个亚组再分别与对照组进行差异表达分析.利用GO富集和KEGG富集对差异表达基因(DEGs)进行生物学功能和途径注释.应用cytoHubba识别中心基因.结果 RSA1和对照组主要富集在与核分裂、细胞分裂等细胞周期相关,代谢途径有蛋白质消化吸收和细胞外基质(ECM)受体相互作用;RSA2组和脂质、氨基酸代谢过程的调控有关,代谢途径主要有花生四烯酸代谢和甲状腺激素合成;RSA3组和金属离子等细胞信号有关.结论 RSA1亚组的细胞周期明显失调;RSA2亚组的脂质、氨基酸代谢失调;RSA3亚组的细胞信号失调.
文献关键词：
复发性流产;亚组分析;批次效应;一致性聚类
中图分类号：
作者姓名：
林泳煌;刘兴华;王红心;杨晓雨;樊文龙;陈东宇;何玉清
作者机构：
广东医科大学公共卫生学院流行病与医学统计学系,广东东莞523808;广东医科大学寮步医院,广东东莞523400
文献出处：
引用格式：
[1]林泳煌;刘兴华;王红心;杨晓雨;樊文龙;陈东宇;何玉清-.不明原因复发性流产患者的基因表达谱亚组分析)[J].中国妇幼保健,2022(19):3629-3634
A类：
GSE165004,GSE26787,Cluste,RSA1,RSA2,RSA3
B类：
不明原因复发性流产,流产患者,基因表达谱,亚组分析,子宫内膜,生物学过程,GEO,ComBat,批次效应,Consensus,ring,无监督聚类,差异表达分析,差异表达基因,DEGs,生物学功能,cytoHubba,中心基因,核分裂,细胞分裂,细胞周期,代谢途径,消化吸收,细胞外基质,ECM,氨基酸代谢,代谢过程,花生四烯酸代谢,甲状腺激素,金属离子,细胞信号,代谢失调,一致性聚类
AB值：
0.282457
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