典型文献
基于网络药理学探讨淫羊藿苷治疗动脉粥样硬化的机制
文献摘要:
目的 以网络药理学为基础,探讨淫羊藿苷(Icaritin)治疗动脉粥样硬化的机制.方法 结合研究的需求由PubChem和Swiss Target Prediction数据库获取Icaritin的靶点信息,基于GeneCards、OMIM、PharmGkb、DisGeNET、Drugbank和TTD数据库获取动脉粥样硬化相关靶点,在对共同靶点进行KEGG与GO富集分析时选择R语言工具,同时应用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,在进行关键靶点的分子对接时选择AutoDock、AutoDockVina、ChemBio3D和Pymol工具.结果 共获得79种Icaritin与动脉粥样硬化相关靶点,PPI网络中核心基因为TP53、TNF、AKT1、RELA和EGFR等;GO功能富集后富集数目较多的有protein kinase C activity、protein serine/threonine kinase activity、protein phosphatase binding和phosphatase binding等;KEGG富集通路分析显示Icaritin治疗动脉粥样硬化主要通路有Sphingolipid signaling pathway、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications、Chemical carcinogenesis-receptor activation和HIF-1 signaling pathway等;分子对接结果显示核心靶点蛋白与Icaritin的对接分数均小于-5 kcal/mol,提示分子对接的高亲和力.结论 Icaritin或通过利用多靶点、多通路抑制氧化应激和细胞增殖改善动脉血管重塑.
文献关键词:
动脉粥样硬化;淫羊藿苷;网络药理学;靶点;作用机制
中图分类号:
作者姓名:
郭英杰;许锦荣;林俊颜;刘左玲;左玲
作者机构:
广东医科大学附属第二医院心内科,广东湛江 524000;广州医科大学第一临床医学院,广东广州 510120;广东医科大学附属第二医院中医科,广东湛江524000
文献出处:
引用格式:
[1]郭英杰;许锦荣;林俊颜;刘左玲;左玲-.基于网络药理学探讨淫羊藿苷治疗动脉粥样硬化的机制)[J].广东医科大学学报,2022(05):508-514
A类:
Icaritin,ChemBio3D
B类:
网络药理学,淫羊藿苷,动脉粥样硬化,结合研究,PubChem,Swiss,Target,Prediction,GeneCards,OMIM,PharmGkb,DisGeNET,Drugbank,TTD,富集分析,语言工具,蛋白质相互作用,PPI,关键靶点,分子对接,接时,AutoDockVina,Pymol,共获,核心基因,TP53,AKT1,RELA,EGFR,功能富集,protein,kinase,activity,serine,threonine,phosphatase,binding,富集通路,通路分析,Sphingolipid,signaling,pathway,RAGE,diabetic,complications,Chemical,carcinogenesis,receptor,activation,HIF,核心靶点,靶点蛋白,kcal,亲和力,多靶点,多通路,抑制氧化,动脉血,血管重塑
AB值:
0.399557
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