目的 构建一个基于Notch通路相关基因的结肠腺癌预后模型并通过列线图绘制进行验证.方法 下载TC-GA结肠腺癌患者的mRNA表达量和临床病理资料.GSEA(gene set enrichment analysis)分析Notch信号通路相关基因集,筛选癌与癌旁组织中差异表达的基因.单因素与多因素Cox比例回归模型进行预后相关mRNAs的筛选,并构建基于mRNAs表达谱的预后模型和列线图,通过生存分析C-index、ROC曲线和校准曲线评估其预测价值.从GEO数据库中下载验证队列GSE29621,对预后模型预测患者预后的有效性进行验证.使用在线网站人类蛋白图谱(HPA)对预后模型内基因进行蛋白表达情况验证.结果 从TCGA中下载444例结肠腺癌患者mRNA表达数据和临床病理资料,排除临床资料不全的患者信息,最终纳入385例患者的信息作为研究对象.从GSEA中3个Notch信号通路基因集中获取Notch相关基因,并与TCGA表达数据结合,得到Notch相关基因的表达量,最后进行Notch相关基因的差异基因的筛选.使用GSEA在结肠腺癌mRNAs表达谱中筛选出391个Notch信号通路相关差异表达基因(P<0.05).利用单变量Cox回归分析筛选出14个结肠腺癌预后相关Notch通路基因,进一步多变量Cox回归分析构建出5种mR-NAs(CDHR2,KRT8P12,NEURL1B,SELE,FSTL3)组成的预后模型.ROC曲线和生存分析显示,高Notch通路相关基因风险评分与较差的生存结果显著相关(AUC=0.748,P<0.05).Notch通路相关的基因评分被证明是一个独立的预后因素.构建了具有临床病理特征和Notch通路相关基因评分的列线图,进一步预测结肠腺癌患者的预后,在C-in-dex、ROC曲线和校准曲线上也表现良好(C-index=0.794,AUC=0.969).结论 构建的包含5个Notch信号通路相关基因的结肠腺癌预后模型具有良好的预后预测效果,有望作为评估结肠腺癌患者预后的指标.

临床预后模型;结肠腺癌;Notch信号通路;列线图

王俊杰;詹雪冰;罗倩;况云舒;陶香香;朱晓群;梁箫;赵同洋;陈冰

皖南医学院病理学教研室,安徽 芜湖 241002

右江民族医学院学报

[1]王俊杰;詹雪冰;罗倩;况云舒;陶香香;朱晓群;梁箫;赵同洋;陈冰-.基于Notch通路相关基因结肠癌预后模型的构建及验证)[J].右江民族医学院学报,2022(03):373-381

GSE29621,CDHR2,KRT8P12,NEURL1B,SELE

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