典型文献
基于数据库挖掘探究JAK3在头颈鳞状细胞癌中的预后评估价值
文献摘要：
目的 通过生物信息学方法分析Janus激酶3(JAK3)在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达及预后的评估价值.方法 从TCGA数据库获取正常组织及HNSCC组织中JAK3的表达数据,分析JAK3在HNSCC中的共表达基因,利用GSEA算法,分析确定JAK3参与的生物学过程及功能,采用Survival和Sur-vminer R软件包进行Kaplan-Meier分析,评估预后价值.通过CIBERSORT对免疫细胞浸润进行量化,分析免疫细胞浸润与JAK3表达的关系,JAK3基因与免疫检查点基因表达量的相关性,使用Estimate包对肿瘤样品免疫微环境打分.分别运用TCIA数据库和pRRophetic包评估PD-1、CTLA4免疫治疗的反应和4种化疗药物的疗效.结果 JAK3在HNSCC中存在高表达现象,与JAK3的共表达基因主要涉及免疫系统中淋巴细胞CD6、LCK等相关基因,GO富集提示JAK3分布于核糖体,与细胞因子受体相互作用,富集的KEGG信号通路主要与B细胞受体通路、抗原受体介导的信号等通路相关,患者的生存时间与JAK3表达量呈正相关.免疫治疗PD-1对于JAK3高表达组更敏感.结论 JAK3在HNSCC中高表达,与HNSCC预后密切相关,并与免疫治疗的疗效相关,可作为HNSCC预后预测的标志物之一,并指导个体化治疗.
文献关键词：
JAK3;鳞状细胞癌;头颈;生物信息学;免疫治疗;预后
中图分类号：
作者姓名：
王珍珍;沈毅;郝文娟;黄钧涛;成立新
作者机构：
315040宁波,宁波市医疗中心李惠利医院
文献出处：
引用格式：
[1]王珍珍;沈毅;郝文娟;黄钧涛;成立新-.基于数据库挖掘探究JAK3在头颈鳞状细胞癌中的预后评估价值)[J].现代实用医学,2022(12):1549-1552,封2,封3
A类：
vminer
B类：
JAK3,头颈鳞状细胞癌,预后评估价值,生物信息学方法,Janus,HNSCC,TCGA,正常组织,共表达基因,GSEA,生物学过程,Survival,软件包,Kaplan,Meier,评估预后,预后价值,CIBERSORT,免疫细胞浸润,免疫检查点基因,基因表达量,Estimate,免疫微环境,打分,TCIA,pRRophetic,CTLA4,免疫治疗,化疗药物,免疫系统,CD6,LCK,核糖体,细胞因子受体,细胞受体,抗原受体,生存时间,预后预测,个体化治疗
AB值：
0.297947
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