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典型文献
基于网络药理学研究金银花对糖尿病的作用机制
文献摘要:
目的 基于网络药理学方法阐明金银花治疗糖尿病主要活性成分、作用靶点,揭示其潜在作用机制.方法 依据中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)挖掘金银花的活性成分与对应靶点,以药动学参数[生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、类药性(drug-likeness,DL)≥0.18]为条件进行筛选,运用人类基因-疾病相关的数据库(GeneCards)、OMIM数据库筛选出金银花活性成分的糖尿病靶点;运用Cytoscape 3.8.2绘制"成分-靶点-疾病"网络,借助STRING数据库绘制蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络图;应用R 4.0.4软件及Bioconductor软件对金银花潜在作用的糖尿病靶点的基因本体(gene ontology,GO)以及京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路进行分析;使用RCSB PDB和TCMSP数据库、Pymol和AutoDockTools 1.5.6软件对金银花核心化合物和靶点进行分子对接.结果 从金银花中筛选得到DL及口服吸收较好的16个主要活性成分,预测治疗糖尿病的相关靶点120个,GO功能分析及KEGG通路富集分析显示,金银花治疗糖尿病作用机制主要涉及DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合等生物过程,并通过脂质与动脉硬化、PI3K-Akt信号通路和TNF信号通路等多条通路共同发挥作用;分子对接结果显示,金银花核心化合物中的木犀草素、槲皮素以及山柰酚对AKT 1具有较高亲和力.结论 金银花治疗糖尿病是多成分、多靶点、多通路的作用结果,这为金银花治疗糖尿病的进一步研究提供了理论基础.
文献关键词:
金银花;网络药理学;糖尿病;分子对接;作用机制
作者姓名:
韩明丽;田丹;车欣宇;余金毅;肖昂;潘国军;肖娜
作者机构:
山东农业大学农学院,山东泰安 271018;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安 271016
引用格式:
[1]韩明丽;田丹;车欣宇;余金毅;肖昂;潘国军;肖娜-.基于网络药理学研究金银花对糖尿病的作用机制)[J].山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报,2022(03):172-177
A类:
B类:
网络药理学,药理学研究,金银花,主要活性成分,作用靶点,潜在作用,系统药理学,药理学分析,分析平台,Traditional,Chinese,Medicine,Systems,Pharmacology,Database,Analysis,Platform,TCMSP,掘金,药动学参数,生物利用度,oral,bioavailability,OB,类药性,drug,likeness,DL,人类基因,疾病相关,GeneCards,OMIM,Cytoscape,STRING,蛋白互作,protein,interaction,PPI,网络图,Bioconductor,基因本体,gene,ontology,京都基因和基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,RCSB,PDB,Pymol,AutoDockTools,分子对接,选得,口服吸收,功能分析,通路富集分析,生物过程,动脉硬化,PI3K,Akt,多条,木犀草素,槲皮素,山柰酚,AKT,亲和力,多成分,多靶点,多通路
AB值:
0.394603
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