典型文献
网络药理学联合GEO芯片及分子对接探讨通窍活血汤治疗阿尔茨海默病的机制
文献摘要:
目的 通过网络药理学联合GEO芯片和分子对接预测通窍活血汤(TQHXD)治疗阿尔茨海默病(AD)的核心成分及分子靶点.方法 通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)筛选TQHXD的活性成分和疾病靶点;R软件分析GEO芯片AD差异基因;通过String数据库对药物-疾病交集基因构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;通过Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑学分析及核心靶点筛选;R软件进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过AutoDock vina、Pymol进行分子对接和结果展示.结果 共获得TQHXD 107个活性成分,对应236个作用靶点;1262个AD差异基因;药物与疾病交集基因31个;基因富集分析多与炎症相关;筛选得到TQHXD的核心活性成分quercetin、luteolin、ellagic acid、paeoniflorin及核心靶点NFKBIA、IL6、CCL2;分子对接显示TQHXD核心成分与核心靶点之间有较好的结合活性.结论 TQHXD可能通过参与炎症信号通路及相关生物功能作用于NFKBIA、IL6、CCL2等疾病靶点,发挥治疗AD作用.
文献关键词:
网络药理学;GEO芯片;通窍活血汤;阿尔茨海默病;分子对接
中图分类号:
作者姓名:
王伟;宫秀群
作者机构:
南京大学医学院附属盐城第一医院/盐城市第一人民医院神经内科,江苏盐城 224001;盐城市精神心理疾病临床与转化研 究所,江苏盐城 224001;安徽理工大学附属医院神经内科,安徽淮南 232001
文献出处:
引用格式:
[1]王伟;宫秀群-.网络药理学联合GEO芯片及分子对接探讨通窍活血汤治疗阿尔茨海默病的机制)[J].中国药物经济学,2022(10):92-101,105
A类:
TQHXD
B类:
网络药理学,学联,GEO,分子对接,通窍活血汤,阿尔茨海默病,AD,核心成分,分子靶点,系统药理学,数据库分析,分析平台,TCMSP,综合数据库,TCMID,活性成分,差异基因,String,对药,交集,蛋白质相互作用,PPI,Cytoscape,拓扑学,核心靶点,靶点筛选,基因本体,京都基因和基因组百科全书,通路富集分析,AutoDock,vina,Pymol,共获,作用靶点,基因富集分析,选得,quercetin,luteolin,ellagic,acid,paeoniflorin,NFKBIA,IL6,CCL2,结合活性,炎症信号通路,生物功能,功能作用
AB值:
0.339845
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