目的 运用网络药理学联合加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究雷公藤治疗系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)的潜在作用机制.方法 利用TCMSP数据库检索雷公藤的主要活性成分,并挖掘活性成分相关靶点,通过GEO平台下载SLE相关基因芯片GSE65391,使用R软件limma包进行差异分析,并运用WGCNA筛选出的模块基因作为疾病靶点基因.R软件Venn Diagram包进行交集分析并可视化.利用ADEx平台对交集靶点基因的表达情况进行Meta分析.采用R软件clusterProfiler包对交集靶点基因进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.采用Cytoscape软件进行"药物–活性成分–共同靶点"网络的构建与分析.将交集靶点基因上传至STRING数据库,把结果数据导入至Cytoscape软件构建蛋白相互作用(PPI)网络并筛选核心靶点基因.表达量分析、PPI分析、诊断效能分析被用于展示核心靶点基因的作用与临床价值.采用PyMOL软件对核心活性成分与核心靶点基因进行分子对接验证.利用R软件并通过CIBERSORT算法对样本的免疫细胞分布进行计算.结果 共筛选出有效活性成分50个,成分相关靶点690个,WGCNA关联模块基因1215个;KEGG通路分析,主要涉及Toll样受体等信号通路;筛选出山柰酚、雷公藤甲素、triptofordin B1、异落叶松脂素4个核心成分和SIRT1核心靶点基因.分子对接结果显示,山柰酚和雷公藤甲素与SIRT1具有稳定的结合能力.免疫浸润分析结果显示,SIRTI主要通过抑制中性粒细胞发挥抗SLE作用.结论 雷公藤可能从抗炎、调节免疫细胞功能等多方面发挥对SLE的治疗作用,为雷公藤治疗SLE提供了研究思路和理论支撑.

雷公藤;系统性红斑狼疮;生物信息学;分子对接;山柰酚;雷公藤甲素;免疫浸润;抗炎;调节免疫

孟祥文;贾晓益;陆志远;程芷洛;谭亚楠;张敏

安徽中医药大学 药学院,安徽 合肥 230012;中国科学技术大学附属第一医院(安徽省立医院) 风湿免疫科,安徽 合肥 230001

现代药物与临床

[1]孟祥文;贾晓益;陆志远;程芷洛;谭亚楠;张敏-.基于网络药理学联合加权基因共表达网络分析探究雷公藤治疗系统性红斑狼疮的免疫作用机制)[J].现代药物与临床,2022(10):2215-2225

GSE65391,ADEx,triptofordin,SIRTI

网络药理学,学联,联合加权,加权基因共表达网络分析,分析探究,系统性红斑狼疮,免疫作用,WGCNA,systemic,lupus,erythematosus,SLE,潜在作用,TCMSP,数据库检索,主要活性成分,GEO,台下,下载,基因芯片,limma,靶点基因,Venn,Diagram,交集靶点,clusterProfiler,基因本体论,功能富集,京都基因与基因组百科全书,信号通路富集,通路富集分析,Cytoscape,STRING,数据导入,软件构建,蛋白相互作用,PPI,核心靶点,表达量分析,诊断效能,效能分析,临床价值,PyMOL,分子对接,CIBERSORT,通路分析,Toll,样受体,出山,山柰酚,雷公藤甲素,B1,落叶松,松脂素,核心成分,SIRT1,结合能,免疫浸润,调节免疫,免疫细胞功能,治疗作用

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