典型文献
胃腺癌肿瘤微环境中基质和免疫相关预后基因的鉴定
文献摘要：
目的 基于ESTIMATE算法探讨胃腺癌(Stomach adenocarcinoma,STAD)肿瘤微环境中基质评分和免疫评分与STAD患者的预后和临床特征相关性,并提出了几个与肿瘤微环境相关的STAD预后生物标志物.方法 我们使用来自癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的数据和ESTIMATE算法评估了STAD的基质和免疫评分,评价评分与STAD患者预后和临床特征的关系.根据评分获得差异表达基因,并鉴定预后相关基因.功能富集分析和蛋白互作网络(PPI网络)进一步揭示这些基因参与的生物学过程.结果 基质评分与STAD患者的预后相关,基质及免疫评分均与临床特征相关.通过基质和免疫评分识别出241个共同差异基因,组建出一个PPI网络,同时进行单变量Cox回归分析.接下来对PPI网络中的核心节点基因与上述单变量Cox回归分析获取的显著性基因交叉分析,获得11个与STAD患者生存相关的基因,分别是:MPO,DPT,IGHD3-16,ELANE,AC110995.1,BPI,FAM216B,OGN,PTGDS,IGHJ1,IGLC5.我们选择其中三个关键基因(MPO,ELANE和BPI)进行单基因分析,并阐明它们与临床病理特征的关系.结论 肿瘤微环境的基质和免疫评分与STAD患者的预后及临床特征相关,我们确定了11个可能与肿瘤微环境相关并影响STAD患者预后的基因(MPO,DPT,IGHD3-16,ELANE,AC110995.1,BPI,FAM216B,OGN,PTGDS,IGHJ1,IGLC5),其中MPO、ELANE和BPI可能是STAD潜在的预后标志物和治疗靶点.
文献关键词：
胃腺癌;肿瘤微环境;预后;TCGA
中图分类号：
作者姓名：
费习昌;彭瑶;张明军
作者机构：
230601 安徽医科大学第二附属医院肿瘤科
文献出处：
引用格式：
[1]费习昌;彭瑶;张明军-.胃腺癌肿瘤微环境中基质和免疫相关预后基因的鉴定)[J].现代消化及介入诊疗,2022(11):1436-1442
A类：
IGHD3,AC110995,FAM216B,IGHJ1,IGLC5
B类：
胃腺癌,癌肿,肿瘤微环境,免疫相关,预后基因,ESTIMATE,Stomach,adenocarcinoma,STAD,免疫评分,预后生物标志物,癌症基因组图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,分获,差异表达基因,预后相关基因,功能富集分析,蛋白互作网络,PPI,生物学过程,差异基因,Cox,接下来,核心节点,节点基因,交叉分析,MPO,DPT,ELANE,BPI,OGN,PTGDS,关键基因,单基因分析,临床病理特征,预后标志物,治疗靶点
AB值：
0.256505
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