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基于生物信息学NOP2在肝癌中的预后价值研究
文献摘要：
目的:基于生物信息学探究NOP2核仁蛋白(NOP2 nucleolar protein,NOP2)在肝癌预后中的价值.方法:采用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,计算497例(其中54例有癌旁组织)肝癌病人的肿瘤浸润免疫细胞(TICs)的两个主要评分.通过Cox回归分析寻找出差异表达基因(DEGs).同时进一步收集蚌埠医学院第一附属医院行肝切除术的原发性肝癌病人10对癌组织及相邻癌旁组织进行qRT-PCR分析.结果:NOP2的表达水平与肝癌的病理特征(较晚的M分期)呈正相关,与病人的生存时间呈负相关.通过基因集富集分析(GSEA)发现NOP2高表达的基因主要富集于与免疫相关通路.进一步研究证实6种免疫细胞与NOP2表达呈正相关,包括M0巨噬细胞、静止期自然杀伤细胞、激活期CD4+记忆T细胞、CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞、调节性T细胞.5种免疫细胞与NOP2的表达水平呈负相关,包括记忆B细胞、嗜酸性粒细胞、M2巨噬细胞、单核细胞、休止期CD4+记忆T细胞.且qRT-PCR显示NOP2在肝癌中呈高表达,在癌旁呈低表达.结论:NOP2在肝癌中呈高表达,且与生存时间成负相关,其表达水平可有助于预测肝癌病人的预后,尤其是对于肿瘤微环境中免疫相关细胞的影响.
文献关键词：
肝肿瘤;NOP2;肿瘤微环境
中图分类号：
作者姓名：
徐之端;张懿刚;刘双池;周凯;吴斌全;尹宏祥;谈燚
作者机构：
蚌埠医学院第一附属医院 普外科,安徽 蚌埠233004
文献出处：
引用格式：
[1]徐之端;张懿刚;刘双池;周凯;吴斌全;尹宏祥;谈燚-.基于生物信息学NOP2在肝癌中的预后价值研究)[J].蚌埠医学院学报,2022(12):1654-1658
A类：
B类：
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AB值：
0.348867
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