典型文献
生物信息学分析慢性阻塞性肺疾病在肺癌中的影响
文献摘要：
目的:基于生物信息学分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)状态对非小细胞肺癌(NSCLC)的影响，以期揭示COPD状态对非小细胞肺癌的影响。方法:从癌症基因组图谱数据库中下载161例肺癌患者的相关信息并根据病理类型与肺功能结果进行分组。在同一病理下，比较有无COPD的两组的差异。京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)分析用于功能富集分析，进行加权共表达网络分析(WGCNA)并构建蛋白互作网络(PPI)筛选核心枢纽基因。所有计量资料组间比较采用
t检验，计数资料组间比较采用
χ2检验。
结果:本研究纳入了161例肺癌患者的样本数据。有、无COPD在临床特征、体细胞基因突变频率以及免疫细胞浸润上差异无统计学意义(
P>0.05)。在鳞癌及腺癌中，COPD组别中大量代谢有关通路上调，而细胞趋化能力的调节等通路下调。后续WGCNA及PPI分析鉴定出钠离子通道α2亚基(SCN2A)、富酪蛋白(STATH)、细胞色素P450家族成员(CYP1A2及CYP1B1)、γ-氨基丁酸A型受体亚基(GABRA1)紧密连接蛋白17 (CLDN17)、调节突触膜胞吐蛋白1 (RIMS1)、维生素D结合蛋白(GC)以及血浆铜蓝蛋白(CP)可能是潜在枢纽基因。只有在腺癌中，COPD组的患者年龄组成比率上[<60岁：80.8%(21/26)；>60岁：19.2%(5/26)]相比无COPD组[<60岁：56.1%(32/57)；>60岁：43.9%(25/57)]，结果差异有统计学意义(
χ2＝4.693，
P<0.05)。
结论:COPD状态对肺癌的预后，体细胞突变等无贡献，并提出9个潜在的COPD型肺癌关键枢纽基因。
文献关键词：
慢性阻塞性肺疾病;非小细胞肺癌;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
孟恒;宋从宽;李宁;江万里;耿庆
作者机构：
武汉大学人民医院胸外科 430060
文献出处：
引用格式：
[1]孟恒;宋从宽;李宁;江万里;耿庆-.生物信息学分析慢性阻塞性肺疾病在肺癌中的影响)[J].中华实验外科杂志,2022(06):1173-1175
A类：
STATH,CLDN17,RIMS1
B类：
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AB值：
0.277571
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