典型文献
骨性关节炎软骨下骨改变中的潜在生物标志物
文献摘要:
目的:通过生物信息学分析骨性关节炎(OA)软骨下骨改变过程中的潜在生物标志物及相关通路。方法:从基因表达数据库(GEO)下载GSE51588数据集,鉴定差异表达基因(DEGs)并进行富集分析。构建蛋白互作网络(PPI),模块分析并筛选Hub基因。预测Hub基因的靶向MicroRNAs(miRNAs),鉴定关键miRNAs并绘制其受试者工作特征(ROC)曲线。结果:最终鉴定出与OA软骨下骨改变相关的10个Hub基因,3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、白蛋白(ALB)、骨髓肿瘤细胞(MYC)、Toll样受体2(TLR2)、髓过氧化物酶(MPO)、中性粒细胞表达的弹性蛋白酶(ELANE)、甲酰肽受体2(FPR2)、精氨酸酶1(ARG1)、前血小板碱性蛋白(PPBP)、甲酰肽受体1(FPR1),及8个关键miRNAs(hsa-miR-6809-3p、hsa-miR-4263、hsa-miR-6759-5p、hsa-miR-6165、hsa-miR-6754-5p、hsa-miR-5588-5p、hsa-miR-877-3p、hsa-miR-4270)。结论:本研究结果显示的潜在生物标志物及相关通路为OA的诊断和治疗研究提供候选靶点。
文献关键词:
骨性关节炎;基因;微小RNAs
中图分类号:
作者姓名:
杨明义;苏亚妮;郑海石;许珂;万贤杰;马宇杰;许鹏
作者机构:
西安交通大学附属红会医院骨坏死与关节重建科 710054;延安大学医学院 716000
文献出处:
引用格式:
[1]杨明义;苏亚妮;郑海石;许珂;万贤杰;马宇杰;许鹏-.骨性关节炎软骨下骨改变中的潜在生物标志物)[J].中华实验外科杂志,2022(04):749-752
A类:
GSE51588
B类:
骨性关节炎,软骨下骨,骨改变,潜在生物标志物,生物信息学分析,OA,相关通路,基因表达数据库,GEO,下载,差异表达基因,DEGs,富集分析,蛋白互作网络,PPI,Hub,MicroRNAs,miRNAs,受试者工作特征,变相,磷酸甘油,甘油醛,醛脱氢酶,GAPDH,ALB,骨髓肿瘤,肿瘤细胞,MYC,Toll,样受体,TLR2,髓过氧化物酶,MPO,弹性蛋白酶,ELANE,甲酰肽,FPR2,精氨酸酶,ARG1,PPBP,FPR1,hsa,3p,5p,诊断和治疗,治疗研究
AB值:
0.366349
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