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典型文献
实验小鼠核酸样品单核苷酸多态性标记检测的能力验证结果评价
文献摘要:
目的 通过实施全国范围的小鼠DNA核酸样品单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记检测能力验证计划,检测各实验室小鼠遗传质控SNP检测技术水平,推动核酸样品及SNP检测技术的应用.方法 按照中国食品药品检定研究院2022年组织实施的"NIFDC-PT-365实验小鼠DNA样品SNP标记检测能力验证计划"方案要求,各参加实验室均获得BALB/c和C57BL/6来源的随机编号DNA盲样2份、作业指导书、rs3023177和rs3023382 SNP位点引物2对.参与者在规定时限内提交报告和原始记录,突变位点扩增测序结果与方案预设一致时判为满意,否则判为不满意.同时,对各实验室的PCR扩增体系及测序比对方式进行比较,分析可能影响小鼠核酸标准样品SNP检测结果的相关因素.结果 10个参加实验室在2个SNP位点的盲样测序分型上皆与预设一致,均获得满意结果.不同扩增体积(20μL、25μL、30μL)、不同Taq酶体系(单组分与PCR MIX),以及不同的测序公司、测序方向、比对软件均未影响结果准确性.结论 各参加实验室在小鼠DNA核酸样品SNP标记检测项目上均具有较强的检测能力.SNP检测技术在小鼠遗传质量评价中简便易行,值得推广.
文献关键词:
能力验证;遗传质控;核酸样品;单核苷酸多态性;小鼠
作者姓名:
魏杰;张心妍;王洪;赵蓝;刘巍;李欢;付瑞;乔涵;赵萌;项新华;岳秉飞
作者机构:
中国食品药品检定研究院,北京102629;国家啮齿类实验动物资源库,北京102629
引用格式:
[1]魏杰;张心妍;王洪;赵蓝;刘巍;李欢;付瑞;乔涵;赵萌;项新华;岳秉飞-.实验小鼠核酸样品单核苷酸多态性标记检测的能力验证结果评价)[J].实验动物与比较医学,2022(06):505-510
A类:
遗传质控,rs3023177,rs3023382
B类:
实验小鼠,核酸样品,单核苷酸多态性标记,标记检测,结果评价,single,nucleotide,polymorphism,SNP,检测能力验证,能力验证计划,食品药品,品检,检定,组织实施,NIFDC,PT,BALB,C57BL,编号,盲样,作业指导书,引物,定时限,提交,原始记录,突变位点,判为,否则,标准样品,测序分型,Taq,单组分,MIX,影响结果,结果准确性,检测项目,遗传质量,简便易行
AB值:
0.300752
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