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典型文献
基于孟德尔随机化法的BMI与2型糖尿病因果关系研究
文献摘要:
目的:采用孟德尔随机化法,以单核苷酸多态性(SNP)为工具变量,探究BMI与2型糖尿病(T2DM)的因果关系.方法:从 IEU OpenGWAS project 网站获得近 3 a、样本量最大的 BMI(ieu-b-40)及 T2DM(ebi-a-GCST006867)的GWAS数据.从ieu-b-40中筛选与BMI高度相关的SNP(以P<5×10-8为筛选条件,连锁不平衡系数r2 为0.001,连锁不平衡区域宽度为10 000 kb).从ebi-a-GCST006867中提取BMI有关的SNP(最小r2>0.8,缺失的SNP用与其具有高度连锁性的SNP代替,删除无替代位点的SNP).汇总上述两个数据集,剔除与T2DM直接相关的SNP,最终纳入包括rs8047395、rs13021737、rs663128等451个SNP作为工具变量.采用MR-Egger回归、加权中位数法(WME)、随机效应逆方差加权法(IVW)、加权模型4种回归模型分析BMI与T2DM的因果关系.结果:GWAS数据均来源于欧洲人群,男女不限.MR-Egger回归截距项为0.000 3(P=0.826 1),即筛选出的SNP不存在基因多效性.MR-Egger 回归、WME、IVW、加权模型的 OR(95%CI)分别为2.906(2.347~3.598)、2.938(2.676~3.226)、2.842(2.619~3.085)、2.980(2.440~3.638);由于存在异质性(Q=1 289.365,P<0.001),故关注随机效应IVW的结果.结论:BMI是T2DM的危险因素.
文献关键词:
BMI;2型糖尿病;孟德尔随机化
作者姓名:
包绮晗;李承圣;王浩桦;丁子琛;周立雯;丛慧文;王廉源;杨毅;石福艳;潘庆忠;王素珍
作者机构:
潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学系 山东潍坊261053;潍坊医学院公共卫生学院数学教研室 山东潍坊261053
引用格式:
[1]包绮晗;李承圣;王浩桦;丁子琛;周立雯;丛慧文;王廉源;杨毅;石福艳;潘庆忠;王素珍-.基于孟德尔随机化法的BMI与2型糖尿病因果关系研究)[J].郑州大学学报(医学版),2022(05):645-649
A类:
IEU,OpenGWAS,ieu,ebi,GCST006867,rs8047395,rs13021737,rs663128
B类:
孟德尔随机化,因果关系,单核苷酸多态性,SNP,工具变量,T2DM,project,样本量,连锁不平衡,平衡系数,r2,平衡区,kb,连锁性,删除,代位,MR,Egger,加权中位数,中位数法,WME,随机效应,加权法,IVW,欧洲人,不限,截距,基因多效性
AB值:
0.247627
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