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利用RNA-seq探讨谷氨酰胺剥夺对喉癌细胞转录组的影响
文献摘要：
目的 利用RNA-seq技术研究谷氨酰胺剥夺对喉癌细胞基因表达谱的影响.方法 CCK8检测喉癌细胞增殖速度,RNA sequence检测转录组学的改变.结果 谷氨酰胺剥夺限制喉癌细胞的增殖,转录组分析发现谷氨酰胺剥夺导致328个基因上调,210个基因下调;GO分析发现上述基因与细胞代谢、蛋白质和核苷酸的合成相关;KEGG信号通路分析发现上述基因与O-多聚糖、糖基磷脂酰肌醇的生物合成,果糖、甘露糖、氨基酸和核苷酸的代谢,P53信号通路相关;疾病富集发现差异表达的基因主要与头颈部肿瘤相关.结论 谷氨酰胺剥夺限制核酸代谢、RNA和蛋白质的结合,影响P53信号通路.
文献关键词：
喉癌;谷氨酰胺代谢;RNA测序
中图分类号：
作者姓名：
王晓亭;陈正侬;易红良
作者机构：
上海交通大学附属第六人民医院 耳鼻咽喉头颈外科/上海市睡眠呼吸障碍疾病重点实验室/上海交通大学耳鼻咽喉研究所,上海200233
文献出处：
引用格式：
[1]王晓亭;陈正侬;易红良-.利用RNA-seq探讨谷氨酰胺剥夺对喉癌细胞转录组的影响)[J].山东大学耳鼻喉眼学报,2022(02):26-31,39
A类：
B类：
剥夺,喉癌细胞,基因表达谱,CCK8,sequence,转录组学,细胞的增殖,转录组分析,细胞代谢,通路分析,多聚糖,糖基磷脂,磷脂酰肌醇,生物合成,果糖,甘露糖,P53,差异表达,头颈部肿瘤,肿瘤相关,酸代谢,谷氨酰胺代谢
AB值：
0.254545
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