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PM2.5暴露对慢性鼻窦炎患者鼻黏膜上皮细胞影响的转录组学分析
文献摘要：
目的 研究PM2.5暴露对慢性鼻窦炎患者鼻黏膜上皮细胞(human nasal epithelial cells,HNECs)基因表达的影响,并探讨可能作用的机制.方法 6例慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的HNECs气液交界培养后分为对照组(PBS处理)和PM2.5组(100μg/ml PM2.5处理),干预24h后提取各组细胞RNA进行转录组学测序(RNA sequencing,RNA-seq),筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并进行基因本体论(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,采用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-PCR)检测关键基因(CYP1A1、CYP1B1)的表达.结果 RNA-seq表明PM2.5组与对照组相比DEGs共279个,其中上调表达76个,下调表达203个,CYP1A1和CYP1B1是排名前两位的上调DEGs,而下调DEGs主要与DNA复制和蛋白质合成相关.通过GO和KEGG富集分析发现DEGs主要参与应激反应、氧结合、脂类物质代谢等,其中细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)酶起重要作用.RT-PCR结果显示,PM2.5组CYP1A1、CYP1B1表达量显著上调(P<0.05),这与RNA-seq测序结果一致.结论 PM2.5可能通过调控CYP450酶中相关基因的表达,影响脂类物质代谢诱导HNECs氧化应激和促炎反应.
文献关键词：
颗粒物;转录组序列;鼻窦炎;鼻息肉;PM2.5;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
胡蒲圻;矫健;王向东;蔡超
作者机构：
首都医科大学附属北京佑安医院耳鼻咽喉头颈外科,北京 100069;首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科,北京市耳鼻咽喉科研究所,耳鼻咽喉头颈科学教育部重点实验室(首都医科大学),鼻病研究北京市重点实验室,北京 100005
文献出处：
引用格式：
[1]胡蒲圻;矫健;王向东;蔡超-.PM2.5暴露对慢性鼻窦炎患者鼻黏膜上皮细胞影响的转录组学分析)[J].中国耳鼻咽喉头颈外科,2022(09):592-595
A类：
HNECs
B类：
PM2,鼻黏膜上皮细胞,转录组学分析,human,nasal,epithelial,cells,慢性鼻窦炎伴鼻息肉,气液,PBS,ml,24h,转录组学测序,sequencing,差异表达基因,differentially,expressed,genes,DEGs,基因本体论,ontology,京都基因与基因组百科全书,kyoto,encyclopedia,genomes,富集分析,real,fluorescence,quantitative,关键基因,CYP1A1,CYP1B1,蛋白质合成,应激反应,脂类物质,物质代谢,细胞色素,cytochrome,CYP450,促炎反应,颗粒物,转录组序列
AB值：
0.270287
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