典型文献
宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌肺病的诊断价值
文献摘要：
目的:探讨宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在非结核分枝杆菌肺病(nontuberculous mycobacterial pulmonary disease,NTM-PD)中的诊断价值.方法:回顾性搜集 2020 年 1 月至2022年2月浙江大学医学院附属杭州市胸科医院结核病诊疗中心收治的123例疑似NTM-PD患者的资料.根据诊断标准,123例疑似NTM-PD患者最终诊断为NTM-PD患者(NTM-PD组;74例)和非NTM-PD患者(非NTM-PD组;49例).123例患者肺泡灌洗液、痰液、肺组织同时进行mNGS、PCR荧光探针法、BACTEC MGIT 960分枝杆菌全自动快速液体培养(简称"液体培养"),比较3种方法的诊断效能.结果:以最终临床诊断结果为标准,mNGS、液体培养及PCR荧光探针法检测NTM-PD的敏感度分别为83.8％(62/74)、78.4％(58/74)、67.6％(50/74),特异度分别为 65.3％(32/49)、91.8％(45/49)、87.8％(43/49),诊断一致率分别为 76.4％(94/123)、83.7％(103/123)、75.6％(93/123),Kappa值分别为 0.524、0.647、0.521.以液体培养结果为标准,mNGS和 PCR荧光探针法检测NTM-PD的敏感度分别为87.1％(54/62)和75.8％(47/62),特异度分别为59.0％(36/61)和85.2％(52/61),诊断一致率分别为 73.2％(90/123)和 80.5％(99/123),Kappa 值分别为 0.462 和 0.587.对 74 例NTM-PD患者菌株进行mNGS及基因芯片法菌种鉴定,以基因芯片法为菌种鉴定标准,mNGS检测的准确率为63.8％(37/58).结论:在NTM-PD的诊断中,mNGS检测的敏感度较高,可直接鉴定至菌种水平,但特异度较低,应重点提高检测特异度,以更好地服务于临床工作.
文献关键词：
基因组学;分枝杆菌;非典型性;诊断技术和方法;对比研究
中图分类号：
作者姓名：
孔娇;陈园园;蔡青山;赵亚芳;喻义杭
作者机构：
浙江中医药大学第二临床医学院,杭州310053;浙江大学医学院附属杭州市胸科医院结核病诊疗中心,杭州310003
文献出处：
引用格式：
[1]孔娇;陈园园;蔡青山;赵亚芳;喻义杭-.宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌肺病的诊断价值)[J].中国防痨杂志,2022(11):1135-1140
A类：
B类：
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AB值：
0.266351
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